80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0137 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  100 
 
 		 1001 aa  1962    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  46.94 
 
 		 1018 aa  723    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  40.57 
 
 		 1049 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  41.94 
 
 		 1042 aa  614  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  40.94 
 
 		 1049 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  41.3 
 
 		 1048 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  39.94 
 
 		 1049 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  40.51 
 
 		 1048 aa  602  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  40.83 
 
 		 1042 aa  598  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  39.23 
 
 		 1052 aa  593  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  40.15 
 
 		 1053 aa  587  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  41.36 
 
 		 1015 aa  588  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  39.54 
 
 		 1052 aa  575  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  41.16 
 
 		 999 aa  574  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  39.6 
 
 		 1052 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  40.55 
 
 		 1016 aa  563  1.0000000000000001e-159  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  36.48 
 
 		 1047 aa  555  1e-156  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  41.46 
 
 		 1014 aa  551  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  38.32 
 
 		 1043 aa  545  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  38.83 
 
 		 1047 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  38.83 
 
 		 1047 aa  538  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  38.65 
 
 		 1045 aa  531  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  38.52 
 
 		 1040 aa  521  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  38.62 
 
 		 991 aa  514  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  36.65 
 
 		 1064 aa  512  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  39.05 
 
 		 1037 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  35.96 
 
 		 1059 aa  505  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  38.91 
 
 		 1054 aa  499  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  35.95 
 
 		 1076 aa  488  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  35.84 
 
 		 1064 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  35.56 
 
 		 1062 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  36.19 
 
 		 977 aa  452  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  36.93 
 
 		 986 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  37.7 
 
 		 1000 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  34.94 
 
 		 993 aa  433  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  37.24 
 
 		 997 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  37.14 
 
 		 997 aa  432  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  37.33 
 
 		 991 aa  429  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  34.38 
 
 		 988 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  37.66 
 
 		 959 aa  382  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  33.2 
 
 		 980 aa  360  8e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  22.66 
 
 		 911 aa  215  3.9999999999999995e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  22.35 
 
 		 914 aa  195  3e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  23.72 
 
 		 890 aa  190  1e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  28.23 
 
 		 779 aa  85.9  0.000000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.13 
 
 		 836 aa  84  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  25.34 
 
 		 947 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  25.22 
 
 		 976 aa  80.5  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  20.31 
 
 		 911 aa  76.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.31 
 
 		 958 aa  75.5  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  25.37 
 
 		 962 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.76 
 
 		 1049 aa  68.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  26.44 
 
 		 788 aa  67.4  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  26.15 
 
 		 788 aa  65.1  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  21.96 
 
 		 909 aa  65.5  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  23.84 
 
 		 919 aa  64.3  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  26.72 
 
 		 788 aa  64.3  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.07 
 
 		 957 aa  62.8  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  24.71 
 
 		 951 aa  61.6  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.75 
 
 		 989 aa  61.2  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  30.61 
 
 		 846 aa  61.2  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  22.12 
 
 		 786 aa  59.3  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  20.7 
 
 		 794 aa  58.2  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  30.69 
 
 		 855 aa  56.6  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  32.68 
 
 		 856 aa  56.6  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  24.94 
 
 		 780 aa  55.8  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  28.34 
 
 		 864 aa  55.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  26.09 
 
 		 1106 aa  50.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2513  ATP-dependent nuclease subunit B-like  31.55 
 
 		 1029 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260712  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  30.53 
 
 		 940 aa  48.5  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  24.13 
 
 		 781 aa  47.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2640  hypothetical protein  28.04 
 
 		 883 aa  47.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0600209  normal  0.0102086 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  27.78 
 
 		 908 aa  47  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  22.37 
 
 		 1077 aa  47  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  31.67 
 
 		 912 aa  45.8  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  23.89 
 
 		 968 aa  45.8  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  26.83 
 
 		 1151 aa  45.4  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  30.23 
 
 		 259 aa  45.1  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  29.31 
 
 		 990 aa  44.7  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  23.84 
 
 		 984 aa  44.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>