168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3114 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 430 aa  861    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  66.51 
 
 		 429 aa  551  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  49.14 
 
 		 419 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  47.27 
 
 		 440 aa  352  8e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  45.58 
 
 		 444 aa  351  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  46.06 
 
 		 429 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  48.65 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  43.74 
 
 		 438 aa  342  8e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  45.77 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.96 
 
 		 441 aa  332  8e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  46.53 
 
 		 407 aa  331  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  46.39 
 
 		 406 aa  328  8e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  46.84 
 
 		 443 aa  326  5e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  43.45 
 
 		 429 aa  325  8.000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  45.83 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  43.45 
 
 		 429 aa  319  6e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  43.94 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.06 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  44.58 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  45.11 
 
 		 408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  42.36 
 
 		 446 aa  302  9e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  42.08 
 
 		 432 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  41.13 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  40.9 
 
 		 432 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  38.67 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  40.66 
 
 		 432 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  43.26 
 
 		 413 aa  297  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  40.43 
 
 		 432 aa  296  7e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  40.33 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 452 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  42.63 
 
 		 452 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  41.72 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  40.09 
 
 		 434 aa  292  7e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  40.98 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  43.12 
 
 		 452 aa  291  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  41.19 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  41.19 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  41.19 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  40.05 
 
 		 418 aa  266  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  38.42 
 
 		 1140 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  32.33 
 
 		 435 aa  209  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  34.66 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  30.32 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  33.74 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  32.66 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  32.92 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  32.53 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  32.22 
 
 		 420 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  31.67 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  32.51 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  30.33 
 
 		 424 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  30.64 
 
 		 436 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  30.77 
 
 		 423 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  30.77 
 
 		 423 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  30.77 
 
 		 423 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  30.77 
 
 		 423 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  29.95 
 
 		 423 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  30.57 
 
 		 440 aa  173  5.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  33.5 
 
 		 421 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  30.37 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  31.41 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  31.63 
 
 		 415 aa  170  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  31.03 
 
 		 423 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  31.75 
 
 		 415 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  30.42 
 
 		 410 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  31.03 
 
 		 423 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  31.03 
 
 		 423 aa  167  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  32.13 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  32.25 
 
 		 431 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  34.16 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  31.75 
 
 		 431 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  29.48 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  31.75 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  31.18 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  28.37 
 
 		 412 aa  159  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  28.13 
 
 		 432 aa  159  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  30.09 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  32.24 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  33.17 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  31.34 
 
 		 436 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  29.98 
 
 		 431 aa  155  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  32.33 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  30.65 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  30.79 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  28.12 
 
 		 458 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  27.16 
 
 		 403 aa  150  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  30.49 
 
 		 408 aa  149  9e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  29.15 
 
 		 405 aa  146  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  31.76 
 
 		 412 aa  144  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  31.17 
 
 		 413 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  30.52 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  28.85 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  27.55 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  29.12 
 
 		 439 aa  133  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  31.27 
 
 		 428 aa  132  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  29.07 
 
 		 429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  27.07 
 
 		 425 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  27.3 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  28.96 
 
 		 457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  27.53 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>