More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1749 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  76.76 
 
 		 425 aa  687    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  77 
 
 		 425 aa  680    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  78.25 
 
 		 430 aa  675    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 428 aa  865    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  53.79 
 
 		 422 aa  476  1e-133  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  45.28 
 
 		 428 aa  359  5e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  41.51 
 
 		 422 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  39.24 
 
 		 421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  37.03 
 
 		 421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.91 
 
 		 410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  36.32 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  35.05 
 
 		 411 aa  229  5e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.63 
 
 		 432 aa  223  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  33.79 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  32.49 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  32.64 
 
 		 411 aa  219  7e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  36.66 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  33.81 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  32.11 
 
 		 433 aa  216  5e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  31.8 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  31.8 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  33.33 
 
 		 397 aa  206  9e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  35.12 
 
 		 642 aa  200  3e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  33.04 
 
 		 635 aa  200  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  34.16 
 
 		 635 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  31.39 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  31.63 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  32.73 
 
 		 630 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  31.63 
 
 		 422 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  31.52 
 
 		 426 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 		 646 aa  182  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 		 639 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  30.85 
 
 		 640 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  32.79 
 
 		 635 aa  181  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  31.92 
 
 		 635 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  32.61 
 
 		 639 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 		 634 aa  180  4e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 		 640 aa  179  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  32.64 
 
 		 634 aa  179  8e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  32.61 
 
 		 629 aa  177  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  32.19 
 
 		 636 aa  177  4e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 		 635 aa  176  6e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 		 635 aa  176  7e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 		 630 aa  176  8e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 		 635 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 		 635 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  30.09 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 		 821 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  33.49 
 
 		 637 aa  170  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.67 
 
 		 455 aa  170  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.3 
 
 		 636 aa  169  7e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.77 
 
 		 467 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  29.55 
 
 		 644 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  32.44 
 
 		 636 aa  162  9e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 		 465 aa  162  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  30.9 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  29.87 
 
 		 455 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 455 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 		 641 aa  159  8e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  30.66 
 
 		 647 aa  159  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  28.76 
 
 		 644 aa  158  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  30.75 
 
 		 634 aa  156  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  29.37 
 
 		 641 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.08 
 
 		 541 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  28.01 
 
 		 830 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  29.84 
 
 		 452 aa  153  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  30.29 
 
 		 468 aa  152  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  29.84 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.13 
 
 		 460 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  29.27 
 
 		 767 aa  150  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.21 
 
 		 543 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  29.09 
 
 		 515 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 		 455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1883  beta-lactamase domain protein  29.51 
 
 		 456 aa  147  5e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.36 
 
 		 540 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.91 
 
 		 466 aa  146  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  29.8 
 
 		 468 aa  145  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  28.64 
 
 		 468 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 		 460 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  29.4 
 
 		 469 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  28.95 
 
 		 467 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  30.98 
 
 		 467 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  30.91 
 
 		 467 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  29.09 
 
 		 467 aa  142  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 470 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  30.12 
 
 		 667 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  27.29 
 
 		 470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  29.15 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5141  beta-lactamase domain-containing protein  27.79 
 
 		 577 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265268  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  28.33 
 
 		 602 aa  141  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 453 aa  140  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 		 457 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  29.35 
 
 		 452 aa  139  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  28.54 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2642  hypothetical protein  29.36 
 
 		 455 aa  138  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>