184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTOA0047 on replicon NC_004633
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  100 
 
 
183 aa  374  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  96.45 
 
 
169 aa  339  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  59.6 
 
 
223 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  59.73 
 
 
180 aa  192  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  53.18 
 
 
183 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  59.6 
 
 
245 aa  188  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  58.94 
 
 
207 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  58.94 
 
 
242 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  56.95 
 
 
207 aa  185  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  56.95 
 
 
207 aa  185  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  56.95 
 
 
207 aa  185  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  56.95 
 
 
207 aa  185  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  56.95 
 
 
207 aa  185  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  56.95 
 
 
207 aa  185  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  56.95 
 
 
223 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  58.94 
 
 
207 aa  184  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  58.94 
 
 
207 aa  183  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  58.94 
 
 
242 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  58.94 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  53.76 
 
 
176 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  48.57 
 
 
193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  49.39 
 
 
219 aa  158  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  50 
 
 
205 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  50 
 
 
186 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  42.11 
 
 
175 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  36.18 
 
 
177 aa  117  7.999999999999999e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  39.72 
 
 
162 aa  111  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  41.13 
 
 
758 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  36.73 
 
 
176 aa  107  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  40.28 
 
 
234 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  34.23 
 
 
184 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  35.37 
 
 
213 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  35.37 
 
 
213 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  36.99 
 
 
203 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  37.76 
 
 
184 aa  97.1  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  38.26 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  34.46 
 
 
176 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  37.84 
 
 
252 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  34.52 
 
 
176 aa  91.7  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  34.52 
 
 
176 aa  91.7  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  32.35 
 
 
194 aa  88.2  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  32.89 
 
 
189 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  30.92 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  31.51 
 
 
404 aa  87  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  32.03 
 
 
189 aa  86.7  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  34.72 
 
 
203 aa  85.1  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  30 
 
 
196 aa  85.1  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  34.67 
 
 
190 aa  84.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  39.45 
 
 
196 aa  84.7  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.29 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  32.89 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  34.23 
 
 
393 aa  75.1  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.91 
 
 
363 aa  74.7  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  32.21 
 
 
481 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.79 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  32.87 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  28.87 
 
 
487 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  30.38 
 
 
392 aa  68.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25 
 
 
229 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.26 
 
 
219 aa  58.2  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  24.49 
 
 
234 aa  57.8  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.91 
 
 
484 aa  57  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  24.65 
 
 
230 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  25.87 
 
 
230 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  27.13 
 
 
300 aa  57  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.33 
 
 
366 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  27.89 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7357  hypothetical protein  48.21 
 
 
219 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000600434  normal  0.754367 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  25.9 
 
 
151 aa  55.5  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  32.14 
 
 
389 aa  55.1  0.0000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  30.3 
 
 
180 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.77 
 
 
478 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  24.84 
 
 
575 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  28.89 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  29.7 
 
 
558 aa  52.4  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  24.83 
 
 
286 aa  51.6  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  24.14 
 
 
286 aa  51.6  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.36 
 
 
430 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0213  phospholipase D/transphosphatidylase  32.31 
 
 
192 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.387625  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.19 
 
 
560 aa  48.9  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  33.65 
 
 
477 aa  48.9  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  23.98 
 
 
467 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  23.24 
 
 
545 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.99 
 
 
349 aa  48.1  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  23.78 
 
 
545 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  26.71 
 
 
556 aa  48.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  28.93 
 
 
359 aa  47.4  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1907  cardiolipin synthetase domain-containing protein  31.48 
 
 
378 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2054  cardiolipin synthetase domain-containing protein  31.48 
 
 
367 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900063  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  23.98 
 
 
260 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  31.19 
 
 
478 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.26 
 
 
487 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  31.47 
 
 
480 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.65 
 
 
487 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2087  cardiolipin synthetase domain protein  31.48 
 
 
394 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  30 
 
 
486 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.56 
 
 
586 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7368  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  45.1 
 
 
52 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  30 
 
 
486 aa  46.6  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0644  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  24.31 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524645  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>