More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1728 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  96.59 
 
 		 323 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  61.06 
 
 		 323 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2703  secretion protein HlyD family protein  36.51 
 
 		 367 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4808  secretion protein HlyD family protein  40.14 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  32.69 
 
 		 326 aa  185  7e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  38.97 
 
 		 323 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  38.97 
 
 		 323 aa  178  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  38.97 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  35.65 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  36.39 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  35.46 
 
 		 324 aa  172  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  34.7 
 
 		 324 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  34.7 
 
 		 324 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  34.7 
 
 		 324 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  35.14 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  35.14 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  34.7 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1173  secretion protein HlyD family protein  38.85 
 
 		 337 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003317  membrane-fusion protein  32.37 
 
 		 326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  34.19 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 		 357 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1212  hypothetical protein  33.44 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000214097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  33.02 
 
 		 323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0604  secretion protein HlyD family protein  36.31 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0567  secretion protein HlyD family protein  33.64 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.142155 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3745  secretion protein HlyD family protein  33.87 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4571  secretion protein HlyD family protein  36.12 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4393  secretion protein HlyD family protein  32.67 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0477  hypothetical protein  31.76 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  29.87 
 
 		 427 aa  149  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0396  secretion protein HlyD family protein  31.45 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3729  secretion protein HlyD family protein  29.56 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0093  HlyD family secretion protein  31.75 
 
 		 331 aa  145  8.000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0320304 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0618  putative secretion protein, HlyD family  30.74 
 
 		 326 aa  145  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1840  hypothetical protein  30.06 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.137202  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02435  hypothetical protein  32.69 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2701  secretion protein HlyD family protein  32.81 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  28.16 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  29.76 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  28.38 
 
 		 353 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  27.55 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  28.53 
 
 		 354 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  26.6 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  30.69 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  31.02 
 
 		 359 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  26.88 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  30.45 
 
 		 333 aa  93.2  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.62 
 
 		 397 aa  93.2  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  24.85 
 
 		 334 aa  92.8  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  27.51 
 
 		 467 aa  92.8  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  28.68 
 
 		 350 aa  92.4  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  30.2 
 
 		 397 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  28.09 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  26.27 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  25.43 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.63 
 
 		 462 aa  90.1  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  27.68 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  26.25 
 
 		 463 aa  89  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  26.99 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  26.39 
 
 		 331 aa  86.3  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  31.94 
 
 		 357 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  30.8 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  29.86 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  23.65 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  26.02 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  31.9 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  30.95 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  29.26 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  30.95 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  23.64 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  27.15 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  27.15 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1263  efflux transporter  31.03 
 
 		 415 aa  82.8  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.471028  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0097  secretion protein HlyD family protein  26.69 
 
 		 354 aa  82.4  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  31.23 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  24.8 
 
 		 376 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  29.77 
 
 		 377 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3839  secretion protein HlyD  30.85 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.87 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  27.7 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  29.26 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  28.15 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  29.02 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  31.46 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  30.1 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  31.42 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  29.5 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  25.84 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  28.81 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  28.72 
 
 		 456 aa  79.3  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  25.52 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  25.52 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  26.62 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  29.28 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  28.15 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4446  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  29.02 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  29.07 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  26.95 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>