More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0513 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 		 1646 aa  886    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  45.63 
 
 		 1646 aa  887    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  66.99 
 
 		 1629 aa  796    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  54.32 
 
 		 1987 aa  1052    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  54.95 
 
 		 1992 aa  1052    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  57.6 
 
 		 1974 aa  721    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  40.78 
 
 		 2284 aa  701    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 1758 aa  741    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  49.1 
 
 		 1971 aa  721    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  45.2 
 
 		 1647 aa  890    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  56.67 
 
 		 2336 aa  841    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  100 
 
 		 2458 aa  4826    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  42.04 
 
 		 2301 aa  743    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  93.98 
 
 		 2476 aa  4334    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  69.81 
 
 		 2423 aa  2191    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  48.39 
 
 		 2539 aa  1041    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 2212 aa  635  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  46 
 
 		 2301 aa  625  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 1609 aa  626  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 		 1832 aa  615  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  51.66 
 
 		 1834 aa  611  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 		 1725 aa  597  1e-169  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 1725 aa  598  1e-169  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  39.62 
 
 		 1866 aa  526  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.82 
 
 		 1960 aa  521  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  39.85 
 
 		 2048 aa  516  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 2175 aa  517  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 2009 aa  509  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 		 2012 aa  505  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  38.46 
 
 		 1888 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  39.11 
 
 		 1989 aa  495  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  39.39 
 
 		 2092 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.82 
 
 		 1956 aa  492  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  38.47 
 
 		 2026 aa  491  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  38.22 
 
 		 2026 aa  488  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 2164 aa  488  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  36.82 
 
 		 1970 aa  485  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  38.17 
 
 		 1983 aa  484  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 		 1907 aa  474  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 		 2414 aa  468  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 2022 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  40 
 
 		 1643 aa  458  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  40.29 
 
 		 2070 aa  453  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 		 2137 aa  451  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1127 aa  340  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.01 
 
 		 1180 aa  335  7.000000000000001e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.09 
 
 		 2325 aa  333  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 934 aa  331  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 1616 aa  321  9e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 1065 aa  321  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 1155 aa  320  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  29.24 
 
 		 769 aa  318  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 1098 aa  318  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 952 aa  315  6.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 755 aa  315  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  30.07 
 
 		 769 aa  314  1e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 1098 aa  314  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 1078 aa  313  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 1012 aa  312  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  29.24 
 
 		 769 aa  311  8e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  35.4 
 
 		 803 aa  311  1.0000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  29.54 
 
 		 774 aa  309  4.0000000000000004e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.94 
 
 		 764 aa  308  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  35.04 
 
 		 770 aa  307  1.0000000000000001e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  34.89 
 
 		 785 aa  307  2.0000000000000002e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 977 aa  306  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.83 
 
 		 1197 aa  305  6.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  34.28 
 
 		 783 aa  303  2e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  31.67 
 
 		 768 aa  303  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  32.11 
 
 		 764 aa  303  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 765 aa  300  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.76 
 
 		 769 aa  300  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.2 
 
 		 789 aa  298  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 762 aa  298  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 767 aa  297  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  34.77 
 
 		 770 aa  298  1e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  33.98 
 
 		 752 aa  297  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 928 aa  297  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  30.76 
 
 		 911 aa  295  5e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  35.69 
 
 		 793 aa  293  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 1125 aa  293  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  34.91 
 
 		 878 aa  292  7e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 741 aa  291  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 742 aa  291  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 1137 aa  290  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 974 aa  288  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 804 aa  287  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 1736 aa  287  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 679 aa  286  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 740 aa  286  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  29.38 
 
 		 734 aa  286  5.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.84 
 
 		 864 aa  284  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.84 
 
 		 864 aa  284  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.84 
 
 		 864 aa  284  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.84 
 
 		 864 aa  284  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  27.56 
 
 		 801 aa  283  3e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  31.84 
 
 		 864 aa  283  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  31.84 
 
 		 864 aa  283  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 760 aa  281  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 781 aa  281  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>