More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3575 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  98.63 
 
 		 801 aa  1616    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 801 aa  1632    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  94.88 
 
 		 800 aa  1554    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  76.71 
 
 		 802 aa  1274    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  42.27 
 
 		 805 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  40.22 
 
 		 819 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  42.19 
 
 		 804 aa  561  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  41.03 
 
 		 804 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  39.17 
 
 		 809 aa  554  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  40.15 
 
 		 808 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  40.68 
 
 		 728 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  40.66 
 
 		 734 aa  511  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  41.94 
 
 		 771 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  40.68 
 
 		 777 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  41.95 
 
 		 762 aa  500  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  40.62 
 
 		 728 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  38.27 
 
 		 823 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  40.48 
 
 		 726 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  42.32 
 
 		 725 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  40.34 
 
 		 772 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  40.34 
 
 		 772 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  39.8 
 
 		 746 aa  488  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  37.76 
 
 		 729 aa  489  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  40.21 
 
 		 768 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  39.85 
 
 		 753 aa  481  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  38.02 
 
 		 744 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  37.16 
 
 		 804 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  41.1 
 
 		 773 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109366 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  38.48 
 
 		 737 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  40.92 
 
 		 749 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  40.15 
 
 		 722 aa  463  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  40.43 
 
 		 753 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  39.97 
 
 		 770 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  38.16 
 
 		 761 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  38.21 
 
 		 754 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  39.6 
 
 		 773 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  36.64 
 
 		 879 aa  452  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  38.57 
 
 		 737 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  39.07 
 
 		 729 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  36.56 
 
 		 851 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  36.7 
 
 		 839 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  37.46 
 
 		 746 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  36.72 
 
 		 720 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3084  TonB-dependent siderophore receptor  38.78 
 
 		 764 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159276  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  38.36 
 
 		 730 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  39.12 
 
 		 722 aa  436  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  36.31 
 
 		 768 aa  435  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  36.31 
 
 		 763 aa  435  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  38.47 
 
 		 709 aa  432  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  37.08 
 
 		 755 aa  426  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  37.03 
 
 		 724 aa  418  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  35.98 
 
 		 730 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  36.44 
 
 		 761 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  36.15 
 
 		 756 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2669  putative ferric siderophore receptor protein precursor  37.99 
 
 		 742 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  36.18 
 
 		 764 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  37.15 
 
 		 729 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  35.89 
 
 		 728 aa  404  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  36.8 
 
 		 731 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  37.41 
 
 		 700 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  35.79 
 
 		 712 aa  391  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  36.21 
 
 		 758 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  32.39 
 
 		 804 aa  392  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 		 759 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  26.08 
 
 		 811 aa  226  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 811 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 728 aa  224  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 727 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  29.62 
 
 		 710 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  29.48 
 
 		 729 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 698 aa  217  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 727 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.72 
 
 		 724 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 710 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 743 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 743 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 742 aa  207  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 743 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 724 aa  206  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 		 743 aa  206  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 		 774 aa  204  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  27.79 
 
 		 705 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  29.52 
 
 		 743 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 751 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 743 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  27.85 
 
 		 712 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 726 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 716 aa  197  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 702 aa  197  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 702 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 710 aa  191  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 728 aa  190  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  26.57 
 
 		 727 aa  189  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 		 828 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 778 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 730 aa  177  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.41 
 
 		 704 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 685 aa  174  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 706 aa  173  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 729 aa  170  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>