126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0573 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  100 
 
 		 574 aa  1154    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  95.33 
 
 		 554 aa  1021    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  83.8 
 
 		 554 aa  907    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  63.13 
 
 		 552 aa  692    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  46.88 
 
 		 558 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  31.56 
 
 		 555 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  30.65 
 
 		 558 aa  253  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.65 
 
 		 581 aa  246  8e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.65 
 
 		 581 aa  246  8e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  30.02 
 
 		 561 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.02 
 
 		 561 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.7 
 
 		 569 aa  236  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  29.7 
 
 		 569 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.29 
 
 		 561 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.02 
 
 		 561 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.29 
 
 		 561 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  29.61 
 
 		 557 aa  231  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1655  hypothetical protein  30.18 
 
 		 588 aa  227  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.74 
 
 		 561 aa  226  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  28.74 
 
 		 561 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0147  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.37 
 
 		 572 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  27.86 
 
 		 551 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  27.86 
 
 		 551 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  27.86 
 
 		 551 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  27.86 
 
 		 559 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  27.86 
 
 		 551 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  27.86 
 
 		 551 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  27.86 
 
 		 559 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  27.66 
 
 		 597 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  25.81 
 
 		 565 aa  200  7e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.39 
 
 		 559 aa  123  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  26.39 
 
 		 599 aa  115  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.54 
 
 		 560 aa  109  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.05 
 
 		 553 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  25.35 
 
 		 568 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  25.35 
 
 		 568 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  25.75 
 
 		 550 aa  97.8  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2095  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.51 
 
 		 592 aa  97.4  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.61 
 
 		 639 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  25.97 
 
 		 595 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.61 
 
 		 584 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  24.36 
 
 		 607 aa  94.4  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  22.85 
 
 		 585 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  23.09 
 
 		 584 aa  91.3  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3190  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.75 
 
 		 589 aa  91.3  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.07 
 
 		 747 aa  87.4  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.05 
 
 		 583 aa  87  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  24.6 
 
 		 595 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  22.67 
 
 		 588 aa  84.7  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  24.68 
 
 		 556 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  25.74 
 
 		 608 aa  81.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  24.35 
 
 		 692 aa  80.5  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.34 
 
 		 548 aa  80.5  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.9 
 
 		 1391 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.44 
 
 		 586 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.43 
 
 		 580 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.59 
 
 		 554 aa  75.1  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.05 
 
 		 585 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.62 
 
 		 585 aa  73.6  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  32.5 
 
 		 567 aa  71.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.1 
 
 		 1570 aa  71.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.61 
 
 		 572 aa  70.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.43 
 
 		 1349 aa  70.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.39 
 
 		 569 aa  70.5  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.46 
 
 		 554 aa  70.5  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  23.56 
 
 		 587 aa  67.8  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  23.33 
 
 		 568 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  25.71 
 
 		 567 aa  66.6  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  25.71 
 
 		 567 aa  66.6  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  25.71 
 
 		 567 aa  66.6  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  31.82 
 
 		 553 aa  66.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2383  hemolysin activation/secretion protein-like  27.36 
 
 		 624 aa  64.7  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418836  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  23.53 
 
 		 568 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.29 
 
 		 561 aa  63.5  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  25.74 
 
 		 545 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  23.79 
 
 		 596 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.79 
 
 		 596 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  24.52 
 
 		 558 aa  62  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.54 
 
 		 590 aa  61.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.59 
 
 		 567 aa  60.8  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.74 
 
 		 578 aa  60.5  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  23.79 
 
 		 596 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  24.05 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.34 
 
 		 587 aa  59.3  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.79 
 
 		 571 aa  59.3  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.07 
 
 		 574 aa  59.3  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.36 
 
 		 575 aa  58.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.4 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  24.87 
 
 		 576 aa  56.2  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  22.99 
 
 		 607 aa  56.2  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0482  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.01 
 
 		 579 aa  55.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  21.96 
 
 		 442 aa  54.7  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.07 
 
 		 591 aa  54.3  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.07 
 
 		 591 aa  54.3  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.07 
 
 		 591 aa  54.3  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.07 
 
 		 592 aa  54.3  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.66 
 
 		 561 aa  54.3  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  24.83 
 
 		 575 aa  53.5  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.8 
 
 		 585 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.69 
 
 		 608 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.910139 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>