More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_18720 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  100 
 
 
321 aa  645  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  95.02 
 
 
321 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  71.23 
 
 
315 aa  416  1e-115  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  64.17 
 
 
300 aa  415  1e-115  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  61.76 
 
 
302 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  62.99 
 
 
308 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  60.38 
 
 
313 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  60.65 
 
 
317 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  68.66 
 
 
301 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  60.83 
 
 
324 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  38.06 
 
 
296 aa  201  1e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  37.41 
 
 
322 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  36.26 
 
 
309 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  34.39 
 
 
294 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  33.99 
 
 
294 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  28.47 
 
 
289 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  29.1 
 
 
290 aa  137  3e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  29.06 
 
 
289 aa  136  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 
289 aa  135  7e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  2.67219e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 
289 aa  135  7e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.40538e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 
289 aa  135  7e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  3.20218e-09  hitchhiker  1.31905e-07 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 
289 aa  135  7e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.49804e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  27.93 
 
 
287 aa  135  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  29.43 
 
 
286 aa  135  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  31.05 
 
 
294 aa  134  1e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.08227e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  29.25 
 
 
289 aa  134  2e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.9607e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  27.89 
 
 
290 aa  133  4e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.91416e-06  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  27.89 
 
 
290 aa  132  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  5.3368e-07  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  27.74 
 
 
289 aa  132  1e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  27.89 
 
 
290 aa  132  1e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  8.19929e-09  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  25.6 
 
 
291 aa  129  7e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  26.79 
 
 
289 aa  128  1e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.24837e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  29.17 
 
 
289 aa  127  2e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.4464e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  30.38 
 
 
292 aa  127  2e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  27.51 
 
 
297 aa  125  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.46772e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  28.27 
 
 
293 aa  121  2e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.66037e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  30.58 
 
 
304 aa  116  4e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  29.13 
 
 
293 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  29.8 
 
 
303 aa  111  1e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  29.64 
 
 
280 aa  99.8  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  27.97 
 
 
350 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  24.73 
 
 
339 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  24.09 
 
 
295 aa  81.3  2e-14  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  37.01 
 
 
670 aa  79.7  6e-14  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 
498 aa  79  1e-13  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  36.67 
 
 
656 aa  78.2  2e-13  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  31.97 
 
 
543 aa  75.1  1e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 
306 aa  75.1  2e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  36.52 
 
 
1313 aa  74.3  2e-12  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  36.63 
 
 
544 aa  74.3  3e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  46.74 
 
 
490 aa  73.6  4e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  44.09 
 
 
230 aa  73.6  4e-12  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 
638 aa  73.6  4e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.15 
 
 
542 aa  72.8  7e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  35.04 
 
 
1755 aa  72.8  8e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 
231 aa  72.8  8e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  38.14 
 
 
224 aa  72.4  9e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 
506 aa  71.6  2e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  39.05 
 
 
266 aa  71.2  2e-11  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  40.66 
 
 
424 aa  70.5  3e-11  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  50.75 
 
 
225 aa  70.1  4e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  35.09 
 
 
510 aa  70.5  4e-11  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  36.54 
 
 
222 aa  69.7  6e-11  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  36.44 
 
 
294 aa  69.3  7e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  37.93 
 
 
320 aa  69.3  8e-11  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  35.57 
 
 
270 aa  69.3  9e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.54 
 
 
220 aa  69.3  9e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  41.41 
 
 
311 aa  68.6  1e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  41 
 
 
310 aa  68.6  1e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  41 
 
 
310 aa  68.6  1e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
220 aa  68.6  1e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  41 
 
 
310 aa  68.6  1e-10  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  41 
 
 
310 aa  68.6  1e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  41 
 
 
310 aa  68.6  1e-10  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
220 aa  68.2  2e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  50.68 
 
 
247 aa  67.8  2e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  41 
 
 
310 aa  68.2  2e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  41 
 
 
310 aa  68.2  2e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  50.68 
 
 
240 aa  68.2  2e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  49.32 
 
 
240 aa  67.8  2e-10  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  34.58 
 
 
193 aa  68.2  2e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  32.45 
 
 
271 aa  68.2  2e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  36.45 
 
 
226 aa  68.2  2e-10  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  36.84 
 
 
220 aa  68.2  2e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  50.68 
 
 
236 aa  68.2  2e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  33.77 
 
 
270 aa  67.8  2e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  36.45 
 
 
630 aa  67.4  3e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  34.68 
 
 
537 aa  67.4  3e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  33.11 
 
 
271 aa  67  4e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  33.56 
 
 
270 aa  67  4e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 
224 aa  67  4e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 
215 aa  67  4e-10  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  33.56 
 
 
270 aa  67  4e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  31.43 
 
 
890 aa  67  4e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  41.3 
 
 
210 aa  66.6  5e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.07187e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  33.56 
 
 
270 aa  66.6  5e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 
459 aa  67  5e-10  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  35.92 
 
 
658 aa  66.6  5e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  41.3 
 
 
210 aa  66.6  5e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  35.09 
 
 
517 aa  66.2  6e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>