More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3212 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3212  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  100 
 
 		 332 aa  653    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0166332  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3541  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  87.85 
 
 		 327 aa  548  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1194  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  87.85 
 
 		 327 aa  548  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  84.38 
 
 		 334 aa  550  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  83.78 
 
 		 334 aa  548  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0509  type II secretion system protein E  82.73 
 
 		 329 aa  539  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  86.54 
 
 		 342 aa  534  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  84.52 
 
 		 343 aa  534  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2324  type II secretion system protein E  85.94 
 
 		 327 aa  535  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1484  type II secretion system protein E  85.2 
 
 		 332 aa  534  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.307277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  89.14 
 
 		 326 aa  531  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3851  type II secretion system protein E  83.12 
 
 		 327 aa  531  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296178  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  83.28 
 
 		 327 aa  528  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  85.81 
 
 		 328 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  85.3 
 
 		 327 aa  527  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  85.67 
 
 		 327 aa  521  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  81.56 
 
 		 328 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3541  type II secretion system protein E  83.23 
 
 		 322 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478777  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  83.49 
 
 		 322 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3827  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  82.61 
 
 		 321 aa  514  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  80 
 
 		 327 aa  497  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  81.91 
 
 		 326 aa  495  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  83 
 
 		 305 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3364  conjugal transfer protein trbB  82.24 
 
 		 326 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  81.03 
 
 		 328 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2824  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  82.05 
 
 		 329 aa  478  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  78.57 
 
 		 322 aa  478  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  77.6 
 
 		 334 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2614  type II secretion system protein E  82.95 
 
 		 327 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0318  type II secretion system protein E  78.71 
 
 		 327 aa  459  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504933  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2485  type II secretion system protein E  76.39 
 
 		 327 aa  436  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  69.13 
 
 		 325 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  62.2 
 
 		 325 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0161  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  69.1 
 
 		 323 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.94 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  59.2 
 
 		 343 aa  355  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0726  type II secretion system protein E  60.49 
 
 		 349 aa  354  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.62 
 
 		 350 aa  352  4e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.469898  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1282  type II secretion system protein E  60.69 
 
 		 356 aa  352  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1341  type II secretion system protein E  59.69 
 
 		 354 aa  349  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3506  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.69 
 
 		 344 aa  348  6e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19636  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2004  type II secretion system protein E  62.01 
 
 		 348 aa  348  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30940  putative conjugal transfer protein  60 
 
 		 356 aa  348  9e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128533  unclonable  3.72388e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1895  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.87 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1550  type II secretion system protein E  61.02 
 
 		 358 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00260971  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2584  conjugal transfer protein TrbB  58.59 
 
 		 355 aa  346  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2645  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  58.86 
 
 		 345 aa  346  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  62.75 
 
 		 344 aa  346  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0438  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.24 
 
 		 353 aa  345  7e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2350  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.31 
 
 		 351 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.526616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2911  type II secretion system protein E  60.44 
 
 		 344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3706  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.13 
 
 		 350 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2351  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  56.55 
 
 		 325 aa  315  8e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  53.67 
 
 		 320 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5159  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  52.58 
 
 		 318 aa  297  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  50.16 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4569  conjugal transfer protein TrbB  50.66 
 
 		 329 aa  269  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  48.68 
 
 		 321 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  48.68 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0688  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.93 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8334  conjugal transfer protein TrbB  48.48 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222514  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  48.56 
 
 		 329 aa  255  7e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00147948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4690  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.97 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  44.44 
 
 		 366 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  46.25 
 
 		 320 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  46.25 
 
 		 320 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.6 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0892  type II secretion system protein E  39.87 
 
 		 319 aa  241  7.999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  48.44 
 
 		 321 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.92 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  47.26 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  44.09 
 
 		 320 aa  239  5e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9661  conjugal transfer protein TrbB  47.51 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2346  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.81 
 
 		 325 aa  235  9e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1183  type II secretion system protein E  39.73 
 
 		 319 aa  232  6e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4274  conjugal transfer ATPase TrbB  46.3 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.39641e-17  normal  0.780952 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.27 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  36 
 
 		 468 aa  170  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  34.38 
 
 		 464 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  39.06 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  35.53 
 
 		 455 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  38.39 
 
 		 450 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  38.46 
 
 		 454 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  37.25 
 
 		 441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  40.07 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  32.61 
 
 		 473 aa  163  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  39.48 
 
 		 438 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  34.69 
 
 		 455 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  36.89 
 
 		 477 aa  162  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  34.21 
 
 		 451 aa  162  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  34.38 
 
 		 455 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  34.59 
 
 		 454 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  34.59 
 
 		 454 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  34.59 
 
 		 454 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  35.88 
 
 		 442 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  34.38 
 
 		 455 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  34.38 
 
 		 455 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  34.38 
 
 		 455 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  35.2 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  36.18 
 
 		 460 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>