297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0964 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 152 aa  299  8.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  88.59 
 
 		 153 aa  268  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  88.59 
 
 		 153 aa  268  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  55.7 
 
 		 151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3055  cyclic nucleotide-binding protein  46 
 
 		 151 aa  126  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4229  hypothetical protein  41.73 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000114025  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3764  cyclic nucleotide-binding protein  41.73 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4089  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.41 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0331  cyclic nucleotide-binding protein  43.75 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1772  cyclic nucleotide-binding protein  38.78 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  33.6 
 
 		 154 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1664  cyclic nucleotide-binding protein  37.25 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.617914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4104  cyclic nucleotide-binding protein  39.86 
 
 		 163 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.374225 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.06 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  33.06 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1575  cyclic nucleotide-binding  35.76 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  27.33 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  32.28 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1398  cyclic nucleotide-binding protein  41.43 
 
 		 168 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.144588  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1854  cyclic nucleotide-binding protein  35.1 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1016  cyclic nucleotide-binding protein  40.14 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  30.37 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  30.37 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  31.5 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  27.59 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  31.5 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1291  cyclic nucleotide-binding protein  33.11 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  31.5 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  31.15 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0086  cyclic nucleotide-binding protein  34.21 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.929528  normal  0.0740226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0279  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0178  cyclic nucleotide-binding protein  34.38 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0093  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.99 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.132878  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0285  cyclic nucleotide-binding protein  30.67 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512507  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0380  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.59 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.23 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.8 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 225 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.06 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.63 
 
 		 231 aa  63.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0441  cyclic nucleotide-binding  28 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.25 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.15 
 
 		 173 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.62 
 
 		 219 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  29.03 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  35.09 
 
 		 729 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1521  cyclic nucleotide-binding protein  30.3 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000183504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1612  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1517  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  30.16 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  32.84 
 
 		 410 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  32.35 
 
 		 226 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2527  cyclic nucleotide-binding protein  29.01 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.122265 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2490  cyclic nucleotide-binding protein  29.01 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.529165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2535  cyclic nucleotide-binding protein  29.01 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.187626  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5025  cyclic nucleotide-binding  36.04 
 
 		 749 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0554599  normal  0.33022 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2352  cyclic nucleotide-binding protein  27.56 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674498  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3676  cyclic nucleotide-binding protein  31.78 
 
 		 1043 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  31.93 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  30.58 
 
 		 570 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.37 
 
 		 624 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0165  cyclic nucleotide-binding  28.7 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30628  predicted protein  31.03 
 
 		 1085 aa  53.9  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1472  CAAX amino terminal protease family  29.6 
 
 		 381 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.407531  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2678  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 1017 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0916435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.36 
 
 		 237 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4541  cyclic nucleotide-binding protein  35.8 
 
 		 426 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0230  cyclic nucleotide-binding protein  31.01 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253117  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0350  cyclic nucleotide-binding protein  29.61 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  28.24 
 
 		 413 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.25 
 
 		 226 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4790  cyclic nucleotide-binding protein  28.7 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 225 aa  52  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4030  cyclic nucleotide-binding protein  25.83 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.67 
 
 		 242 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 226 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.5 
 
 		 224 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  33.03 
 
 		 731 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  32.63 
 
 		 225 aa  50.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4798  cyclic nucleotide-binding protein  28.44 
 
 		 227 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  26.36 
 
 		 495 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  28.36 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6433  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.08 
 
 		 561 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3434  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.78 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 224 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.06 
 
 		 220 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.37 
 
 		 228 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  30.53 
 
 		 419 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 226 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  31.63 
 
 		 598 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 224 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  26.81 
 
 		 286 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  31.03 
 
 		 225 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2685  cAMP-binding protein  29.58 
 
 		 272 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>