211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2198 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  100 
 
 		 519 aa  994    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  50.58 
 
 		 528 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  52.24 
 
 		 512 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  49.03 
 
 		 539 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  43.58 
 
 		 576 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  39.03 
 
 		 513 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  28.86 
 
 		 560 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  27.53 
 
 		 578 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  27.32 
 
 		 564 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  26.5 
 
 		 565 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  22.42 
 
 		 547 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  22.73 
 
 		 549 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  22.39 
 
 		 544 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  22.86 
 
 		 544 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  22.5 
 
 		 549 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  21.2 
 
 		 544 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  21.2 
 
 		 544 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  22.28 
 
 		 547 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  22.34 
 
 		 547 aa  91.3  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  25.47 
 
 		 663 aa  90.9  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  41.18 
 
 		 593 aa  87.4  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  28.9 
 
 		 551 aa  86.7  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  24.7 
 
 		 590 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  26.67 
 
 		 613 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  37.16 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  28.1 
 
 		 577 aa  74.3  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  35.82 
 
 		 302 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  25.88 
 
 		 649 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  38.81 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  41.18 
 
 		 214 aa  65.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.04 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  36.45 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  29.47 
 
 		 718 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  39.58 
 
 		 244 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  33.16 
 
 		 304 aa  63.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  38.68 
 
 		 173 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  38 
 
 		 207 aa  62.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  31.01 
 
 		 686 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  39.25 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.83 
 
 		 731 aa  62  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  33.96 
 
 		 184 aa  62  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  35.65 
 
 		 124 aa  61.6  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  40.83 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  30.24 
 
 		 632 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  31.9 
 
 		 141 aa  61.2  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  31.9 
 
 		 141 aa  61.2  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  37.37 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  38.61 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  34.91 
 
 		 124 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  32.73 
 
 		 869 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  38.54 
 
 		 225 aa  60.1  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  36.79 
 
 		 124 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  36.79 
 
 		 124 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  37.37 
 
 		 265 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  40.2 
 
 		 559 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  36.89 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  26.46 
 
 		 546 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  26.09 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  37.62 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  38.18 
 
 		 124 aa  59.3  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  36.79 
 
 		 124 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  35.34 
 
 		 124 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  36.89 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  36.79 
 
 		 125 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  36.89 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  36.11 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  21.43 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  36.27 
 
 		 126 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  36.27 
 
 		 126 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  36.27 
 
 		 126 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  36.89 
 
 		 146 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  34.35 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  34.48 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  34.29 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  34.23 
 
 		 128 aa  57  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  38 
 
 		 180 aa  57  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  34.48 
 
 		 124 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  34.48 
 
 		 124 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  31.38 
 
 		 687 aa  56.6  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  34.48 
 
 		 124 aa  56.6  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  34.48 
 
 		 124 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  37.11 
 
 		 182 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  35.85 
 
 		 124 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.36 
 
 		 208 aa  56.6  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  34.48 
 
 		 124 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  34.48 
 
 		 124 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  37.27 
 
 		 120 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  32.77 
 
 		 588 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  31.03 
 
 		 319 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  37.76 
 
 		 226 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  32.28 
 
 		 708 aa  55.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  28.89 
 
 		 294 aa  55.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  32.65 
 
 		 292 aa  55.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  30.17 
 
 		 137 aa  54.7  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  34.38 
 
 		 678 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  32.47 
 
 		 316 aa  54.7  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  30.97 
 
 		 226 aa  54.7  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  33.62 
 
 		 124 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  31.37 
 
 		 149 aa  54.3  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  36.73 
 
 		 226 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>