More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2609 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 562 aa  1095    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 554 aa  296  8e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 544 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 544 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  38.92 
 
 		 541 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 544 aa  283  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2045  LuxR family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 547 aa  278  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3766  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 539 aa  277  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484632  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1794  transcriptional regulator, LuxR family  40.64 
 
 		 537 aa  270  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3379  LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 542 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3441  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 542 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0174834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3390  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 542 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1927  transcriptional regulator, LuxR family  41.11 
 
 		 535 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2885  LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 545 aa  230  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.488052  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2591  transcriptional regulator, LuxR family  35.22 
 
 		 552 aa  228  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000770971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3284  transcriptional regulator, CadC  32.7 
 
 		 584 aa  131  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58115 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4920  LuxR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 545 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  30.35 
 
 		 574 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  50.38 
 
 		 982 aa  93.6  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  30.68 
 
 		 567 aa  92.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  42.36 
 
 		 1006 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  44.8 
 
 		 916 aa  77.8  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 209 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  29.17 
 
 		 977 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  38.26 
 
 		 900 aa  70.5  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  43.41 
 
 		 970 aa  70.5  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  53.25 
 
 		 954 aa  70.5  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  56.06 
 
 		 207 aa  70.1  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  55 
 
 		 225 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 222 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 220 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 218 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  47.13 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2881  response regulator receiver  51.28 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00126066  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.79 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3277  transcriptional regulator, LuxR family  45.59 
 
 		 224 aa  67  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.97 
 
 		 216 aa  67  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.38 
 
 		 235 aa  67  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1734  two component LuxR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 257 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159279  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 219 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 208 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 219 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 219 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  55.07 
 
 		 1084 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  48.33 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  48.33 
 
 		 215 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 206 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 768 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 213 aa  65.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 235 aa  66.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 232 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  37.66 
 
 		 222 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 212 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  52.05 
 
 		 886 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  48.33 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001276  transcriptional regulator VpsT  48.28 
 
 		 210 aa  65.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  48.33 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 526 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3826  transcriptional regulator, LuxR family  57.38 
 
 		 519 aa  65.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  50 
 
 		 218 aa  65.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  51.43 
 
 		 526 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  51.43 
 
 		 526 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 210 aa  65.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  37.11 
 
 		 964 aa  65.1  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  48.33 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  48.33 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  48.33 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  48.33 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.28 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.56 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  48.33 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  41.09 
 
 		 967 aa  64.3  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  37.66 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  53.33 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 525 aa  63.9  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  49.28 
 
 		 901 aa  63.5  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  54.84 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1358  two component LuxR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  46.09 
 
 		 937 aa  63.5  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  46.48 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 799 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.08 
 
 		 215 aa  63.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 207 aa  63.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  55 
 
 		 205 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05153  hypothetical protein  44.83 
 
 		 218 aa  63.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 221 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>