More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0894 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 266 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17930  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  48.11 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.481868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.36 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.79 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 		 257 aa  208  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2753  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 		 260 aa  201  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.044107  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  44.66 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  40 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1409  gluconate 5-dehydrogenase  46.48 
 
 		 260 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5289  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0559291  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  45.35 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2353  gluconate 5-dehydrogenase  47.64 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.22 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  42.54 
 
 		 274 aa  188  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  43.63 
 
 		 267 aa  188  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  39.44 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  43.87 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2306  gluconate 5-dehydrogenase  46.85 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00833457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  43.87 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  40.86 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  42.75 
 
 		 261 aa  185  5e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1763  gluconate 5-dehydrogenase  44.27 
 
 		 260 aa  185  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 		 259 aa  185  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3288  short chain dehydrogenase  40.86 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.18 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  42.51 
 
 		 251 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2067  short chain dehydrogenase  40.47 
 
 		 260 aa  181  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0224014 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  40.32 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4004  gluconate 5-dehydrogenase  44.75 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  41.11 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  41.02 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2411  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.94 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 249 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5032  gluconate 5-dehydrogenase  41.13 
 
 		 252 aa  175  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  38.76 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.246968  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1568  short chain dehydrogenase  37.73 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  42.06 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1844  gluconate 5-dehydrogenase  43.25 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250447  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1540  gluconate 5-dehydrogenase  39.29 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0166996  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 		 252 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  42.35 
 
 		 255 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0949  gluconate 5-dehydrogenase  38.89 
 
 		 264 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 		 253 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108758  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 		 259 aa  172  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192229  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 		 253 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.564431  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  40.47 
 
 		 264 aa  171  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 		 269 aa  171  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725023  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07750  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  40 
 
 		 252 aa  171  9e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.370743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.85 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2008  gluconate 5-dehydrogenase  42.75 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0441783  normal  0.700268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1695  gluconate 5-dehydrogenase  42.75 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  38 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3360  gluconate 5-dehydrogenase  41.96 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319469  normal  0.757652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 254 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 		 258 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.063344  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  39.6 
 
 		 256 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  38.91 
 
 		 260 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1896  short chain dehydrogenase  37.74 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  42.08 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 		 253 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0981  2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase, putative  40.32 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0918  putative 2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase  40.32 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.311873  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5798  gluconate 5-dehydrogenase  40.73 
 
 		 251 aa  168  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  hitchhiker  0.00243591 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1448  short chain dehydrogenase  41.31 
 
 		 260 aa  168  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 256 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  38.61 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.718128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1358  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4263  gluconate 5-dehydrogenase  36.11 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 		 256 aa  165  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1263  short chain dehydrogenase  41.09 
 
 		 270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0571  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.53 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.653945  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.44 
 
 		 251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>