179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0227 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 283 aa  565  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  56.03 
 
 		 275 aa  277  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  45.06 
 
 		 275 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  43.25 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  42.96 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  36.79 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  41.82 
 
 		 283 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  43.08 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  35.36 
 
 		 356 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  34.72 
 
 		 365 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  28.37 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  43.27 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  36.51 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  36.51 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  33.73 
 
 		 308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  36.77 
 
 		 281 aa  118  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  31.84 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  35.05 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  30.08 
 
 		 326 aa  99  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0055  putative signal peptide protein  34.6 
 
 		 325 aa  95.9  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.250308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  34.13 
 
 		 349 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  34.13 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  31.85 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  32.14 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  33.06 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  29.52 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  26.25 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4116  dienelactone hydrolase  32.35 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0198407  normal  0.0302336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  27.37 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  30 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7027  hypothetical protein  29.83 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00368212  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  27.97 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  29.17 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  28.18 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2757  hypothetical protein  29.73 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0738  dienelactone hydrolase  29.76 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  25.23 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  29.05 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  24.44 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  29.3 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0643  dienelactone hydrolase  27.78 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.424944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.49 
 
 		 617 aa  55.8  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  30.37 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_24120  predicted protein  34.48 
 
 		 568 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  26.17 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  30.7 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  35.2 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  30.84 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5814  hypothetical protein  34.04 
 
 		 208 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  24.6 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0914  dienelactone hydrolase  26.07 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  26.27 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5100  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.62 
 
 		 635 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  33.05 
 
 		 381 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  27.7 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.35 
 
 		 656 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  31.01 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  35.71 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.94 
 
 		 638 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  32 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  23.51 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  27.5 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  25.86 
 
 		 691 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  26.42 
 
 		 287 aa  49.7  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1095  hypothetical protein  30.82 
 
 		 253 aa  49.7  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.103267 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2192  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.02 
 
 		 701 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0268398  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  26.61 
 
 		 295 aa  49.3  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  25.58 
 
 		 324 aa  49.3  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  21.83 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  26.12 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  29.95 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  23.74 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.53 
 
 		 689 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0053  dienelactone hydrolase  24.9 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  25.9 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  26.82 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  33.59 
 
 		 467 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  25.81 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.95 
 
 		 677 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  30.91 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3058  carboxymethylenebutenolidase, putative  30.5 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2740  Acetyl xylan esterase  24.62 
 
 		 382 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.559874 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  26.48 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  21.62 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  26.48 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  26.48 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  26.48 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  26.48 
 
 		 339 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  26.48 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  35.48 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  27.27 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.37 
 
 		 645 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  25.35 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  31.82 
 
 		 311 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5162  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25 
 
 		 574 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  21.9 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>