104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1193 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  90.23 
 
 
399 aa  684    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  83.96 
 
 
399 aa  638    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  759    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  85.96 
 
 
399 aa  653    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  81.75 
 
 
400 aa  599  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  60 
 
 
405 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  60 
 
 
405 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  60.49 
 
 
405 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  60.24 
 
 
405 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  59.02 
 
 
405 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  53.29 
 
 
420 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  46.82 
 
 
432 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  43.56 
 
 
393 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  45.27 
 
 
375 aa  244  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  58.24 
 
 
620 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  54.68 
 
 
1562 aa  187  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  51.21 
 
 
693 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  57.46 
 
 
578 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  51.98 
 
 
630 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  54.14 
 
 
572 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  49.28 
 
 
692 aa  179  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  52.78 
 
 
762 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  53.37 
 
 
886 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  46.19 
 
 
523 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  53.63 
 
 
892 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  52.25 
 
 
886 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  53.93 
 
 
528 aa  162  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  53.07 
 
 
888 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  46.89 
 
 
737 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  51.96 
 
 
888 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  52.81 
 
 
514 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  52.25 
 
 
516 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  54.75 
 
 
746 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  52.81 
 
 
522 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  46.69 
 
 
735 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  50.28 
 
 
753 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  43.7 
 
 
523 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  50.28 
 
 
536 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  49.16 
 
 
537 aa  149  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  40.54 
 
 
272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  38.86 
 
 
272 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  38.86 
 
 
272 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  39.19 
 
 
272 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  38.86 
 
 
272 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  38.39 
 
 
272 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  40.31 
 
 
300 aa  106  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  39.68 
 
 
275 aa  106  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  39.89 
 
 
275 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  37.23 
 
 
289 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  41.82 
 
 
547 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  31.84 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  26.77 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  26.87 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  30.41 
 
 
292 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  26.16 
 
 
395 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  36.17 
 
 
320 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  28.25 
 
 
260 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  32.2 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  31.07 
 
 
273 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  28.22 
 
 
301 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  29.61 
 
 
279 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  36.17 
 
 
320 aa  64.3  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  44.44 
 
 
380 aa  63.9  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  36.17 
 
 
320 aa  63.5  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  26.73 
 
 
303 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  28.57 
 
 
302 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  28.71 
 
 
301 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  28.16 
 
 
302 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  26.37 
 
 
302 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  36.17 
 
 
320 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  35.51 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  28.49 
 
 
274 aa  60.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  37.89 
 
 
395 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  26.7 
 
 
320 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  36.36 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  31.43 
 
 
275 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  50.88 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  31.14 
 
 
273 aa  56.6  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  30.56 
 
 
274 aa  56.2  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  29.63 
 
 
289 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  26.04 
 
 
282 aa  54.3  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  28.49 
 
 
282 aa  53.9  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  26.47 
 
 
277 aa  53.5  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  35.2 
 
 
389 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  30.54 
 
 
292 aa  52.8  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  34.19 
 
 
311 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  30.85 
 
 
585 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  43.24 
 
 
516 aa  49.7  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  26.52 
 
 
281 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  25.88 
 
 
281 aa  49.7  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  31.91 
 
 
439 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  32 
 
 
282 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  26.72 
 
 
590 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  29.35 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  27.59 
 
 
592 aa  47  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  41.89 
 
 
522 aa  46.6  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  43.66 
 
 
293 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  34.25 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  36.25 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  34.48 
 
 
327 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>