100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1247 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  755    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  88.72 
 
 		 399 aa  678    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  97.49 
 
 		 399 aa  741    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  85.25 
 
 		 400 aa  624  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  83.96 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  61.41 
 
 		 405 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  61.41 
 
 		 405 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  61.89 
 
 		 405 aa  411  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  61.17 
 
 		 405 aa  408  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  60.58 
 
 		 405 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  50.68 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  47.65 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  42.09 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  42.26 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  56.35 
 
 		 578 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  54.7 
 
 		 572 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  57.69 
 
 		 620 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  55.5 
 
 		 1562 aa  180  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  50.47 
 
 		 693 aa  176  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  51.47 
 
 		 630 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  48.58 
 
 		 692 aa  170  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  48.07 
 
 		 523 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  53.33 
 
 		 762 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  53.37 
 
 		 886 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  54.75 
 
 		 892 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  54.19 
 
 		 888 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  52.81 
 
 		 886 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  53.93 
 
 		 528 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  51.96 
 
 		 888 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  53.07 
 
 		 737 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  53.07 
 
 		 536 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  55.31 
 
 		 746 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  52.81 
 
 		 522 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  52.81 
 
 		 514 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  52.25 
 
 		 516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  50.84 
 
 		 753 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  50.84 
 
 		 523 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  51.4 
 
 		 537 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  50.84 
 
 		 735 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  44.69 
 
 		 272 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  41.62 
 
 		 272 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  41.08 
 
 		 272 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  43.01 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  41.62 
 
 		 272 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  41.08 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  40.82 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  37.5 
 
 		 289 aa  104  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  38.86 
 
 		 275 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  38.1 
 
 		 275 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  42.48 
 
 		 547 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  32.8 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  27.67 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  27.32 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  35.11 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  27.23 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  33.15 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  27.45 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  26.87 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  32.6 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  37.23 
 
 		 320 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  26.73 
 
 		 302 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  35.8 
 
 		 273 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  35.11 
 
 		 320 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  29.73 
 
 		 274 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  35.11 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  25.87 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  43.04 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  38.96 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  28.09 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  33.71 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  27.8 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  26.34 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  28.73 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  32.22 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  30.86 
 
 		 275 aa  57  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  29.66 
 
 		 282 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  31.87 
 
 		 321 aa  53.9  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  35.64 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  32.12 
 
 		 273 aa  53.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  35.79 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  23.98 
 
 		 282 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  26.9 
 
 		 292 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  34.65 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  37.84 
 
 		 311 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  29.79 
 
 		 585 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  25.68 
 
 		 281 aa  49.7  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  36.49 
 
 		 389 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  33.7 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  30.85 
 
 		 592 aa  47  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  41.89 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2989  flagellin  29.61 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000626303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  28.5 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1452  flagellin-like  30.37 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  29.33 
 
 		 282 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  29.12 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  28.8 
 
 		 293 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  33.87 
 
 		 281 aa  44.3  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  27.66 
 
 		 590 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  30.41 
 
 		 516 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0101  flagellin domain protein  28.57 
 
 		 273 aa  42.7  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>