110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0349 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  100 
 
 
364 aa  726    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  33.7 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  31.38 
 
 
389 aa  166  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  32.07 
 
 
302 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  30.98 
 
 
303 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  31.25 
 
 
302 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  31.13 
 
 
302 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  31.96 
 
 
302 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  32.07 
 
 
303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  32.15 
 
 
311 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  31.68 
 
 
301 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  31.17 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  30.85 
 
 
311 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  29.75 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  27.67 
 
 
321 aa  116  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  37.64 
 
 
439 aa  109  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  35.33 
 
 
320 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  35.75 
 
 
585 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  35 
 
 
461 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  35.16 
 
 
592 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2555  flagellin domain protein  30.62 
 
 
332 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  33.89 
 
 
461 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  35.9 
 
 
590 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0363  flagellin domain protein  27.32 
 
 
320 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0920574  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  34.62 
 
 
494 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2814  flagellin domain protein  30.47 
 
 
332 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  34.24 
 
 
320 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0331  flagellin domain protein  26.58 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  34.24 
 
 
320 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  34.24 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  34.46 
 
 
293 aa  97.1  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  33.71 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  33.52 
 
 
395 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  34.27 
 
 
395 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  33.33 
 
 
292 aa  89  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  30.98 
 
 
320 aa  86.7  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  31.9 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3219  flagella associated protein  26.76 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  32.02 
 
 
582 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  48.15 
 
 
292 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  34.29 
 
 
380 aa  79.3  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  34.07 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  30.67 
 
 
282 aa  77  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  32.12 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  32.59 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  30.67 
 
 
269 aa  75.9  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  47.62 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  30.66 
 
 
282 aa  72.4  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  27.89 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  40.35 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  26.78 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  39.81 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  52.11 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  46.99 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  33.56 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  53.57 
 
 
516 aa  69.3  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  54.76 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  35.45 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  31.34 
 
 
522 aa  66.6  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  36.45 
 
 
279 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  45.83 
 
 
272 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  26.2 
 
 
327 aa  58.9  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  48.81 
 
 
281 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  48.81 
 
 
281 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  31.91 
 
 
277 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  32.88 
 
 
273 aa  57  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  33.73 
 
 
289 aa  53.1  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  31.33 
 
 
630 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  32.22 
 
 
393 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2876  flagellin-like  23.74 
 
 
282 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1636  flagellin B  29.44 
 
 
518 aa  47.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1339  flagellin  31.54 
 
 
576 aa  47.8  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1528  flagellin  30.56 
 
 
573 aa  47  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  24.14 
 
 
384 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  24.14 
 
 
384 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0223  flagellin  23.83 
 
 
389 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778808  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1526  flagellin  30.34 
 
 
573 aa  46.6  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.227126  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  24.74 
 
 
399 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  28.28 
 
 
693 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0164  flagellin  33.09 
 
 
569 aa  46.6  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.404381  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1635  flagellin B  31.32 
 
 
519 aa  45.8  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0372  flagellin  30.86 
 
 
573 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  27.27 
 
 
692 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  34.25 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4714  flagellin domain protein  52.17 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0875271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  34.25 
 
 
399 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  26.8 
 
 
620 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0077  flagellin domain-containing protein  40 
 
 
274 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104255 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1338  flagellin  32.54 
 
 
576 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  30.37 
 
 
294 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0163  flagellin  33.09 
 
 
569 aa  44.3  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.649103  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  25.77 
 
 
572 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  29.87 
 
 
405 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  29.87 
 
 
405 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  25.62 
 
 
356 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0108  flagellin domain-containing protein  27.47 
 
 
294 aa  43.5  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  22.3 
 
 
369 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  24.38 
 
 
375 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  22.3 
 
 
369 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  30.14 
 
 
405 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>