More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1620 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  100 
 
 
284 aa  556  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  59.43 
 
 
281 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  59.43 
 
 
281 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  55.32 
 
 
282 aa  275  6e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  53 
 
 
292 aa  273  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  54.96 
 
 
282 aa  263  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  55.52 
 
 
281 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  55.71 
 
 
281 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2876  flagellin-like  44.33 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  42.46 
 
 
275 aa  178  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  40.21 
 
 
274 aa  170  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  37.7 
 
 
302 aa  168  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  37.76 
 
 
273 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  35 
 
 
320 aa  162  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  37.38 
 
 
302 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  39.58 
 
 
277 aa  159  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  36.71 
 
 
273 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  36.98 
 
 
303 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  37.68 
 
 
272 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  36.6 
 
 
303 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  37.06 
 
 
273 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  41.02 
 
 
289 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  35.41 
 
 
302 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  34.78 
 
 
321 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  36.18 
 
 
302 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  34.98 
 
 
301 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  37.76 
 
 
274 aa  149  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  33.54 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  35.2 
 
 
301 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  38.57 
 
 
293 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  31.9 
 
 
320 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  36.25 
 
 
328 aa  141  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  31.37 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  36.18 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  34.15 
 
 
277 aa  138  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  38.41 
 
 
327 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  30.75 
 
 
320 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  33.91 
 
 
279 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  40.42 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  33.12 
 
 
311 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  44.1 
 
 
516 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  47.9 
 
 
522 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  36.86 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  32 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2555  flagellin domain protein  32.5 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2814  flagellin domain protein  31.56 
 
 
332 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0363  flagellin domain protein  27.81 
 
 
320 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0920574  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0331  flagellin domain protein  28.15 
 
 
320 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  33.69 
 
 
395 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  27.16 
 
 
321 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  63.01 
 
 
395 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  57.5 
 
 
380 aa  95.1  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  35.43 
 
 
395 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  54.76 
 
 
389 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  35.11 
 
 
494 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  35.11 
 
 
592 aa  89  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  29.14 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  54.76 
 
 
364 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0866  flagellin-like  30.18 
 
 
272 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  33.48 
 
 
269 aa  85.5  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3219  flagella associated protein  29.79 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  28.98 
 
 
278 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  32.98 
 
 
585 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  36.96 
 
 
439 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  28.62 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0108  flagellin domain-containing protein  30.79 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  51.19 
 
 
461 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  33.76 
 
 
590 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  28.62 
 
 
278 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  54.93 
 
 
461 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  27.36 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  26.1 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  27.36 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  27.03 
 
 
279 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0707  flagellin domain protein  28.37 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.478306  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  27.5 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  49.32 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  29.37 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  26.96 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  44.71 
 
 
582 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  26.86 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0760  flagellin-like  29.08 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  27.11 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  28.25 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2036  flagellin domain protein  27.15 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.391359 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  29.41 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  26.69 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3618  flagellin  25.52 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000440531  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3159  putative flagellin  29.9 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00882995  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  27.93 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2534  flagellin-like  27.36 
 
 
298 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  32.93 
 
 
375 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  26.13 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  23.84 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  26.32 
 
 
272 aa  63.5  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  27.4 
 
 
271 aa  63.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  27.4 
 
 
271 aa  63.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  27.49 
 
 
278 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0063  flagellin domain-containing protein  24.65 
 
 
272 aa  63.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  27.24 
 
 
293 aa  62.4  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.414815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>