276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3134 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  100 
 
 		 281 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  80.07 
 
 		 282 aa  412  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  74.82 
 
 		 282 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  71.99 
 
 		 292 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  74.11 
 
 		 281 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  54.64 
 
 		 284 aa  248  9e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  51.25 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  51.25 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2876  flagellin-like  46.48 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  52.26 
 
 		 522 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  47.06 
 
 		 516 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  39.35 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  39.03 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  35.34 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  37.3 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  37.17 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  37.17 
 
 		 301 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  37.5 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  33.54 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  36.84 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  36.04 
 
 		 273 aa  153  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  36.6 
 
 		 303 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  39.86 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  33.54 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  36.86 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  41.26 
 
 		 282 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  35.94 
 
 		 311 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  31.03 
 
 		 320 aa  145  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  36.24 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  35.23 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  31.03 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  35.62 
 
 		 274 aa  142  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  35.07 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  38.59 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  34.63 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  29.15 
 
 		 320 aa  136  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  37.42 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  35.35 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  29.78 
 
 		 320 aa  136  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  32.67 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  31.47 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  35.12 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  31.1 
 
 		 321 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  41.18 
 
 		 395 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  40.48 
 
 		 395 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  42.04 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  37.77 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2814  flagellin domain protein  32.3 
 
 		 332 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2555  flagellin domain protein  32.51 
 
 		 332 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  30.95 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0363  flagellin domain protein  28.38 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0920574  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0331  flagellin domain protein  25.16 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  38.52 
 
 		 439 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3219  flagella associated protein  28.08 
 
 		 319 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  33.9 
 
 		 592 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  34.46 
 
 		 494 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  34.78 
 
 		 380 aa  92  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  28.21 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  33.12 
 
 		 585 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  41.07 
 
 		 461 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  32.3 
 
 		 461 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 		 590 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  34.07 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  50.56 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  33.14 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  29.97 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  26.3 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0866  flagellin-like  28.52 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0623  flagellin domain protein  27.12 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  33.93 
 
 		 582 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  25.61 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  26.8 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  26.46 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0108  flagellin domain-containing protein  27.3 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  26.54 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  25.74 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  25.74 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  26.15 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  25.72 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  26.44 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0760  flagellin-like  29.79 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  26.05 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  26.16 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  29.53 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0707  flagellin domain protein  27.99 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.478306  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  25.67 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  26.62 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  30.36 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  26.62 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2534  flagellin-like  24.83 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  25.86 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  26.58 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  27.57 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  24.15 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  26.53 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  26.21 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3159  putative flagellin  28.12 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00882995  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  27.23 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  26.57 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>