More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0265 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  100 
 
 		 395 aa  771    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  91.9 
 
 		 395 aa  672    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  73.99 
 
 		 395 aa  551  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  49.11 
 
 		 321 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  60.58 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  60.17 
 
 		 302 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  71.35 
 
 		 303 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  65.99 
 
 		 303 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  58.33 
 
 		 302 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  65.78 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  69.1 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  64.71 
 
 		 320 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  64.17 
 
 		 320 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  56.72 
 
 		 301 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  67.42 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  60.43 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  69.1 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  60.96 
 
 		 320 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0363  flagellin domain protein  36.36 
 
 		 320 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0920574  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0331  flagellin domain protein  36.55 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  54.46 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2814  flagellin domain protein  52.07 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2555  flagellin domain protein  50.29 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  46.6 
 
 		 321 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  43.66 
 
 		 585 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  44.75 
 
 		 592 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  40.33 
 
 		 494 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  51.23 
 
 		 327 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  48.21 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  48.21 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  48.86 
 
 		 293 aa  150  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  58.82 
 
 		 289 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  40.8 
 
 		 590 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  51.19 
 
 		 282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  51.19 
 
 		 269 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  30.47 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  42.86 
 
 		 516 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3219  flagella associated protein  42.16 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  60.95 
 
 		 389 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  42.34 
 
 		 582 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  41.01 
 
 		 282 aa  123  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  40.85 
 
 		 522 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  40.46 
 
 		 281 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  41.04 
 
 		 282 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  43.55 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  41.33 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  39.88 
 
 		 292 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  41.18 
 
 		 281 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  40 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  37.11 
 
 		 281 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  37.11 
 
 		 281 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  39.1 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  61.29 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  35.47 
 
 		 284 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  49.09 
 
 		 273 aa  96.7  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  50 
 
 		 273 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  35.2 
 
 		 274 aa  92.8  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  50 
 
 		 273 aa  89.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  37.96 
 
 		 274 aa  89.4  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  27.91 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  40.97 
 
 		 277 aa  87  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  55.56 
 
 		 272 aa  86.3  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  50 
 
 		 279 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  43.68 
 
 		 275 aa  85.9  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  34.97 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  30.17 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  26.17 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  44.94 
 
 		 327 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2876  flagellin-like  32.12 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  26.35 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1478  flagellin domain-containing protein  25.55 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  25.73 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  25.69 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  27.04 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  31.25 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  32.86 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  27.82 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1528  flagellin  33.8 
 
 		 573 aa  66.6  0.0000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  33.88 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  32.14 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  25.37 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  34.04 
 
 		 265 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1339  flagellin  33.87 
 
 		 576 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  26.42 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1635  flagellin B  32.41 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1636  flagellin B  31.72 
 
 		 518 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  24.54 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1835  flagellin  24.62 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000180129  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0372  flagellin  32.39 
 
 		 573 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1338  flagellin  31.75 
 
 		 576 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  26.46 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  26.46 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  30.15 
 
 		 516 aa  63.2  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  28.68 
 
 		 517 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  32.61 
 
 		 271 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  32.61 
 
 		 271 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  30.52 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1526  flagellin  31.97 
 
 		 573 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.227126  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  25.84 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  24.64 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>