More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1040 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  100 
 
 		 292 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  77.66 
 
 		 282 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  75.53 
 
 		 282 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  76.6 
 
 		 281 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  71.99 
 
 		 281 aa  365  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  49.65 
 
 		 281 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  49.65 
 
 		 281 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  53 
 
 		 284 aa  238  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2876  flagellin-like  49.47 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  41.56 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  55.03 
 
 		 522 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  39.61 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  36.84 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  37.74 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  53.41 
 
 		 516 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  35.65 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  36.77 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  34.97 
 
 		 302 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  36.63 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  35.44 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  34.31 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  33.33 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  36.7 
 
 		 289 aa  148  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  35.52 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  37.5 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  36.79 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  29.69 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  29.69 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  30.28 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  34.13 
 
 		 275 aa  142  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  37.25 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  34.8 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  39.79 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  35.07 
 
 		 272 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  33.57 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  27.81 
 
 		 320 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  28.44 
 
 		 320 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  34.85 
 
 		 327 aa  138  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  31.21 
 
 		 279 aa  136  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  35.02 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  30.41 
 
 		 328 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  31.16 
 
 		 277 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  30.9 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  39.88 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  38.73 
 
 		 395 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  41.3 
 
 		 395 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  28.62 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0363  flagellin domain protein  26.37 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0920574  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  37.18 
 
 		 269 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  37.84 
 
 		 380 aa  99.8  5e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0331  flagellin domain protein  26.37 
 
 		 320 aa  99  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  28.78 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  36.73 
 
 		 494 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  29.7 
 
 		 327 aa  92.4  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2814  flagellin domain protein  28.44 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2555  flagellin domain protein  27.5 
 
 		 332 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  33.33 
 
 		 592 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  37.78 
 
 		 439 aa  89  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  37.96 
 
 		 461 aa  89  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3219  flagella associated protein  27.4 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  36.3 
 
 		 585 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  37.23 
 
 		 461 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  35.04 
 
 		 590 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  30.25 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  42.74 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  48.15 
 
 		 364 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  35.04 
 
 		 389 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  25.8 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0866  flagellin-like  28.28 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  31.39 
 
 		 582 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0108  flagellin domain-containing protein  28.1 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  25.8 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  25.09 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  25.7 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2561  flagellin domain protein  27.49 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0623  flagellin domain protein  26.53 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  25.53 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  25.35 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  30.41 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  28.95 
 
 		 420 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  24.83 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  25.98 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  25.98 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  29.82 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  24.44 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  27.7 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0151  flagellin domain-containing protein  31.39 
 
 		 516 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.382062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  31.21 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  27.53 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0707  flagellin domain protein  25.61 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.478306  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1622  flagellin domain protein  28.57 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  26.39 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2534  flagellin-like  23.67 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  25.85 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0156  flagellin  26.74 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447267  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27700  Flagellin  33.1 
 
 		 567 aa  59.3  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2361  flagellin-like  31.13 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  27.8 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  30.71 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  26.18 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>