117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6936 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  73.22 
 
 		 630 aa  824    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  100 
 
 		 620 aa  1168    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  63.13 
 
 		 693 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  62.25 
 
 		 692 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  56.24 
 
 		 1562 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  40.5 
 
 		 578 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  38.67 
 
 		 572 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  52.03 
 
 		 523 aa  227  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  53.36 
 
 		 514 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  52.17 
 
 		 516 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  51.38 
 
 		 522 aa  218  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  40.56 
 
 		 523 aa  212  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  45.83 
 
 		 892 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  40.62 
 
 		 536 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  49.43 
 
 		 537 aa  200  7.999999999999999e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  44.22 
 
 		 888 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  47.24 
 
 		 762 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  48.29 
 
 		 886 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  47.79 
 
 		 528 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  46.39 
 
 		 737 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  39.38 
 
 		 888 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  58.24 
 
 		 397 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  57.69 
 
 		 399 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  56.04 
 
 		 399 aa  187  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  45.8 
 
 		 886 aa  187  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  58.01 
 
 		 405 aa  183  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  58.01 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  57.69 
 
 		 399 aa  182  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  45.88 
 
 		 753 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  39.19 
 
 		 746 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  55.8 
 
 		 405 aa  178  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  55.8 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  54.14 
 
 		 405 aa  174  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  57.14 
 
 		 400 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  52.84 
 
 		 432 aa  171  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  51.43 
 
 		 420 aa  169  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  44.11 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  62.9 
 
 		 735 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  48.52 
 
 		 393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  44.69 
 
 		 272 aa  123  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  44.58 
 
 		 272 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  43.98 
 
 		 272 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  44.94 
 
 		 272 aa  122  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  46.51 
 
 		 272 aa  120  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  44.94 
 
 		 272 aa  120  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  44.91 
 
 		 275 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  39.49 
 
 		 300 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  42.54 
 
 		 275 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  37.1 
 
 		 289 aa  103  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  35.76 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  34.55 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  42.2 
 
 		 547 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  34.84 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  31.64 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  35.76 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  32.26 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  40.62 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  31.18 
 
 		 320 aa  63.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  31.82 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  31.18 
 
 		 320 aa  62.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  27.76 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  31.18 
 
 		 320 aa  60.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  33.7 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  27.47 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  26.86 
 
 		 281 aa  57  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  28.05 
 
 		 275 aa  56.6  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  30.77 
 
 		 585 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  32.95 
 
 		 320 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  34.91 
 
 		 380 aa  56.2  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  30.77 
 
 		 395 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  31.91 
 
 		 302 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  28.32 
 
 		 274 aa  55.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  26.11 
 
 		 282 aa  55.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  30.43 
 
 		 395 aa  55.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  26.52 
 
 		 277 aa  55.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  30.85 
 
 		 302 aa  54.7  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  25 
 
 		 292 aa  53.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  29.07 
 
 		 277 aa  53.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  26.19 
 
 		 274 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  30.56 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  30.61 
 
 		 303 aa  51.2  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  28.57 
 
 		 302 aa  50.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  31.91 
 
 		 321 aa  50.8  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  33.68 
 
 		 327 aa  50.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  31.4 
 
 		 272 aa  50.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  28.57 
 
 		 301 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  30.77 
 
 		 303 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  29.67 
 
 		 311 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0315  flagellin domain-containing protein  28.09 
 
 		 278 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  25.13 
 
 		 301 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  28.57 
 
 		 389 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3618  flagellin  29.78 
 
 		 283 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000440531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  32.88 
 
 		 282 aa  48.5  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  30.84 
 
 		 389 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  27.59 
 
 		 590 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  26.37 
 
 		 592 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1004  flagellar filament core protein  26.37 
 
 		 286 aa  47.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  27.47 
 
 		 302 aa  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  32.97 
 
 		 292 aa  47.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1477  flagellar filament core protein  27.12 
 
 		 286 aa  47.4  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>