100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1105 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  100 
 
 		 536 aa  1024    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  84.39 
 
 		 537 aa  796    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  63.72 
 
 		 523 aa  552  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  59.67 
 
 		 523 aa  551  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  62.04 
 
 		 522 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  61.48 
 
 		 514 aa  535  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  61.21 
 
 		 516 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  59.33 
 
 		 528 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  53.56 
 
 		 888 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  53.28 
 
 		 762 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  50.94 
 
 		 737 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  51.85 
 
 		 888 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  50.12 
 
 		 892 aa  316  7e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  50.25 
 
 		 753 aa  316  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  50 
 
 		 735 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  50.36 
 
 		 746 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  49.88 
 
 		 886 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  57.42 
 
 		 886 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  41.36 
 
 		 693 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  41.1 
 
 		 692 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  40.26 
 
 		 1562 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  40.83 
 
 		 620 aa  194  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  50.95 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  50.95 
 
 		 405 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  50 
 
 		 405 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  52.27 
 
 		 420 aa  163  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  48.57 
 
 		 405 aa  163  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  44.4 
 
 		 375 aa  162  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  48.57 
 
 		 405 aa  161  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  45.89 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  47.19 
 
 		 399 aa  158  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  49.16 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  50.28 
 
 		 397 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  41.94 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  60.47 
 
 		 630 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  54.19 
 
 		 400 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  45.71 
 
 		 393 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  62.38 
 
 		 572 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  60.4 
 
 		 578 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  36.92 
 
 		 272 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  39.9 
 
 		 300 aa  114  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  36.92 
 
 		 272 aa  113  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  37.37 
 
 		 272 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  36.87 
 
 		 272 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  37.31 
 
 		 272 aa  106  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  36.82 
 
 		 272 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  43.12 
 
 		 275 aa  104  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  40.24 
 
 		 275 aa  103  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  36.02 
 
 		 289 aa  102  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  40.32 
 
 		 547 aa  87  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  32.94 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  31.76 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  31.58 
 
 		 260 aa  67  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  32.5 
 
 		 273 aa  60.1  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  28.99 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  31.36 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  28.24 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  34.09 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  34.09 
 
 		 320 aa  57  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  34.09 
 
 		 320 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  32.17 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  31.3 
 
 		 395 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  36.99 
 
 		 320 aa  53.9  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1485  hypothetical protein  45 
 
 		 599 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  27.65 
 
 		 274 aa  53.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  31.82 
 
 		 321 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1099  flagellar basal body rod protein, FlaE  38.21 
 
 		 613 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5535  hypothetical protein  40.16 
 
 		 623 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0408605 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  23.35 
 
 		 302 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  25.99 
 
 		 282 aa  52  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  30.23 
 
 		 289 aa  52  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  23.81 
 
 		 320 aa  51.6  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  36.99 
 
 		 292 aa  51.6  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  29.44 
 
 		 293 aa  51.2  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  31.06 
 
 		 302 aa  51.2  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  27.91 
 
 		 279 aa  50.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  32.22 
 
 		 395 aa  50.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  37.5 
 
 		 389 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3817  hypothetical protein  45.05 
 
 		 598 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  25.14 
 
 		 282 aa  50.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  25.73 
 
 		 277 aa  50.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  30.11 
 
 		 302 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  36.11 
 
 		 311 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  30.43 
 
 		 272 aa  47.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4455  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44 
 
 		 598 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  25.38 
 
 		 301 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  27.27 
 
 		 303 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  24.26 
 
 		 277 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  25.38 
 
 		 302 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  30.11 
 
 		 321 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  34.44 
 
 		 380 aa  46.2  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  29.65 
 
 		 281 aa  46.2  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  35.71 
 
 		 386 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0804  flagellin domain protein  31.3 
 
 		 274 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  30.48 
 
 		 277 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  34.67 
 
 		 282 aa  45.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  29.57 
 
 		 303 aa  44.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  26.32 
 
 		 275 aa  44.3  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1667  hypothetical protein  52.31 
 
 		 610 aa  43.9  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.551124  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1331  flagellar basal body FlaE  38.6 
 
 		 615 aa  43.5  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>