98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4452 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  82.96 
 
 
892 aa  1338    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  68.24 
 
 
886 aa  1048    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  100 
 
 
888 aa  1671    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  67.14 
 
 
762 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  66.4 
 
 
886 aa  1001    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  89.08 
 
 
888 aa  1419    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  62.03 
 
 
737 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  61.64 
 
 
753 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  61.42 
 
 
735 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  63.57 
 
 
746 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  61.52 
 
 
523 aa  357  7.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  59.83 
 
 
523 aa  350  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  53.07 
 
 
536 aa  334  4e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  66.06 
 
 
528 aa  325  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  55.06 
 
 
537 aa  316  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  52.69 
 
 
514 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  48.65 
 
 
516 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  48.46 
 
 
522 aa  312  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  47.56 
 
 
693 aa  208  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  47.65 
 
 
1562 aa  207  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  46.91 
 
 
692 aa  203  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  44.83 
 
 
620 aa  184  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  43.52 
 
 
630 aa  178  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  52.6 
 
 
578 aa  172  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  51.45 
 
 
572 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  55.31 
 
 
405 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  53.07 
 
 
399 aa  168  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  54.19 
 
 
405 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  54.55 
 
 
420 aa  167  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  55.31 
 
 
405 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  53.67 
 
 
405 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  52.51 
 
 
399 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  51.98 
 
 
405 aa  161  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  49.51 
 
 
375 aa  160  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  51.96 
 
 
399 aa  159  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  51.96 
 
 
397 aa  159  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  49.11 
 
 
393 aa  153  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  42.05 
 
 
432 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  53.07 
 
 
400 aa  149  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  38.97 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  40.72 
 
 
272 aa  107  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  43.83 
 
 
275 aa  107  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  42.5 
 
 
275 aa  107  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  38.32 
 
 
272 aa  107  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  37.72 
 
 
272 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  39.52 
 
 
272 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  38.01 
 
 
272 aa  103  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  37.43 
 
 
272 aa  101  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  35.83 
 
 
289 aa  98.2  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  40.37 
 
 
547 aa  77  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 
273 aa  66.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  32.12 
 
 
273 aa  63.9  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3817  hypothetical protein  48.89 
 
 
598 aa  62.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  31.21 
 
 
260 aa  61.6  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  31.4 
 
 
279 aa  60.1  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  33.94 
 
 
272 aa  59.7  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  28.93 
 
 
302 aa  57.4  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  32.9 
 
 
273 aa  56.6  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  29.44 
 
 
301 aa  55.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  40.62 
 
 
289 aa  55.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  28.82 
 
 
292 aa  56.2  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  28.93 
 
 
302 aa  55.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  29.17 
 
 
275 aa  55.5  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  28.49 
 
 
277 aa  53.5  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  29.95 
 
 
301 aa  53.9  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  36.96 
 
 
395 aa  53.5  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  29.44 
 
 
302 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  29.89 
 
 
274 aa  53.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  25.12 
 
 
320 aa  52.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  30 
 
 
293 aa  51.2  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  34.78 
 
 
395 aa  50.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  35.44 
 
 
320 aa  50.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  35.44 
 
 
320 aa  50.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  30.92 
 
 
305 aa  50.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  27.17 
 
 
389 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 
395 aa  50.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  28.43 
 
 
302 aa  48.9  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  35.9 
 
 
311 aa  48.9  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  30.41 
 
 
288 aa  48.1  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  26.32 
 
 
274 aa  48.1  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  31 
 
 
321 aa  48.1  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0612  flagellar hook-associated protein 3  22.62 
 
 
417 aa  47.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.403095  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  34.25 
 
 
320 aa  47  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  26.47 
 
 
277 aa  47.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  37.5 
 
 
380 aa  47.4  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3196  flagellin  34.01 
 
 
383 aa  46.6  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1485  hypothetical protein  37.78 
 
 
599 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  26.77 
 
 
303 aa  45.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  29.55 
 
 
585 aa  45.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3448  flagellin  33.33 
 
 
388 aa  45.4  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0953619  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1671  flagellin  33.33 
 
 
388 aa  45.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3870  flagellin  33.33 
 
 
388 aa  45.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3952  flagellin  33.33 
 
 
388 aa  45.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3102  flagellin  33.33 
 
 
388 aa  45.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0090  flagellin  33.33 
 
 
388 aa  45.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2873  flagellin  33.33 
 
 
388 aa  45.4  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  23.22 
 
 
320 aa  45.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1452  flagellin-like  30.98 
 
 
287 aa  44.3  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000186123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>