95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1489 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1488  flagellin  63.07 
 
 
735 aa  800    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  100 
 
 
746 aa  1390    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  67.11 
 
 
753 aa  853    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  62.81 
 
 
762 aa  806    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  63.12 
 
 
737 aa  818    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  60.93 
 
 
888 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  58.49 
 
 
888 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  63.6 
 
 
892 aa  595  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  62.92 
 
 
886 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  60.99 
 
 
886 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  61.01 
 
 
523 aa  333  9e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  52.67 
 
 
523 aa  333  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  66.54 
 
 
528 aa  320  5e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  49.64 
 
 
536 aa  313  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  52.2 
 
 
537 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  38.67 
 
 
692 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  52.42 
 
 
514 aa  302  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  52.17 
 
 
522 aa  296  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  52.17 
 
 
516 aa  293  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  50 
 
 
1562 aa  212  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  40.84 
 
 
693 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  52.67 
 
 
405 aa  189  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  37.18 
 
 
630 aa  188  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  57.35 
 
 
405 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  55.88 
 
 
405 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  58.33 
 
 
620 aa  180  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  55.31 
 
 
399 aa  173  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  55.31 
 
 
399 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  36.02 
 
 
572 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  55.31 
 
 
399 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  54.75 
 
 
397 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  50.87 
 
 
578 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  52.27 
 
 
420 aa  162  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  54.75 
 
 
400 aa  156  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  52.69 
 
 
375 aa  156  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  44.17 
 
 
432 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  46.75 
 
 
393 aa  144  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  70.71 
 
 
405 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  70.71 
 
 
405 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  42.56 
 
 
300 aa  120  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  43.02 
 
 
272 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  44.51 
 
 
272 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  43.11 
 
 
272 aa  118  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  42.51 
 
 
272 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  41.92 
 
 
272 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  41.92 
 
 
272 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  43.75 
 
 
275 aa  107  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  41.32 
 
 
275 aa  107  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  34.92 
 
 
289 aa  93.2  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  41.94 
 
 
547 aa  78.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  29.95 
 
 
260 aa  67  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  35.71 
 
 
273 aa  63.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  34.52 
 
 
273 aa  63.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  29.38 
 
 
302 aa  60.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  36.78 
 
 
302 aa  59.7  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  27.49 
 
 
302 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  29.41 
 
 
279 aa  58.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  28.5 
 
 
302 aa  58.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  41.67 
 
 
389 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  40.51 
 
 
395 aa  56.2  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  38.96 
 
 
395 aa  56.2  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 
272 aa  56.2  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  32.08 
 
 
321 aa  55.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  36.71 
 
 
320 aa  55.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  36.71 
 
 
320 aa  55.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  29.47 
 
 
289 aa  55.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  29.44 
 
 
292 aa  55.1  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  38.46 
 
 
311 aa  55.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  39.51 
 
 
395 aa  54.7  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  25.89 
 
 
274 aa  54.3  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  34.44 
 
 
320 aa  53.9  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  34.44 
 
 
320 aa  53.5  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  32.47 
 
 
273 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  27.96 
 
 
274 aa  52.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  37.93 
 
 
301 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  28.44 
 
 
301 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  23.29 
 
 
321 aa  50.8  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  25.94 
 
 
303 aa  50.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  35.9 
 
 
303 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  27.98 
 
 
275 aa  49.3  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  26.47 
 
 
277 aa  48.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  25.26 
 
 
282 aa  47.8  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  36.36 
 
 
320 aa  47  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  34.44 
 
 
585 aa  47  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  30.68 
 
 
277 aa  47  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  29.33 
 
 
305 aa  46.2  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  30.43 
 
 
327 aa  46.6  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  27.84 
 
 
293 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  31.06 
 
 
590 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  27.17 
 
 
282 aa  46.2  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  31.36 
 
 
592 aa  45.4  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  32.98 
 
 
494 aa  45.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  37.33 
 
 
281 aa  45.4  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  36.11 
 
 
380 aa  44.7  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  34.25 
 
 
282 aa  44.3  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>