More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2858 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  100 
 
 		 289 aa  565  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  43.1 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  42.46 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  42.11 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  42.11 
 
 		 272 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  40.97 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  39.51 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  38.89 
 
 		 300 aa  176  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  38.68 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  38.11 
 
 		 275 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  42.86 
 
 		 393 aa  138  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  37.63 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  42.22 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  38.8 
 
 		 432 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  42.16 
 
 		 420 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  37.5 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  37.91 
 
 		 630 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  38.04 
 
 		 399 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  32.85 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  37.23 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  37.5 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  39.04 
 
 		 693 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  34.48 
 
 		 536 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  37.1 
 
 		 620 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  37.3 
 
 		 405 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  37.43 
 
 		 405 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  37.43 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  37.97 
 
 		 405 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  37.3 
 
 		 572 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  36.02 
 
 		 537 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  38.41 
 
 		 547 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  37.7 
 
 		 692 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  36.22 
 
 		 405 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  35.83 
 
 		 888 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  34.98 
 
 		 523 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  34.95 
 
 		 762 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  36.65 
 
 		 400 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  32.95 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  35.16 
 
 		 1562 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  30.6 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  36.02 
 
 		 892 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  37.3 
 
 		 886 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  37.97 
 
 		 886 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  36.76 
 
 		 514 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  37.84 
 
 		 578 aa  96.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  35.14 
 
 		 522 aa  96.3  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  34.29 
 
 		 737 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  30.11 
 
 		 274 aa  95.9  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  33.84 
 
 		 753 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  28.42 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  27.95 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  35.14 
 
 		 516 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  34.62 
 
 		 523 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  33.7 
 
 		 888 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  28.21 
 
 		 279 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  28.88 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  34.22 
 
 		 746 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  32.62 
 
 		 528 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  26.94 
 
 		 320 aa  86.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  34.76 
 
 		 735 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  28.21 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  26.6 
 
 		 320 aa  85.9  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  25.96 
 
 		 320 aa  85.5  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  32.2 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  30.3 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  27.48 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  29.15 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  29.39 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  29.71 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  27.53 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  25.18 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  25.89 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  29.23 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  26.39 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  26.37 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  24.56 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  25.38 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  26.48 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  25.08 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  25.93 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  26.97 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  24.91 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  29.2 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  29.2 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  24.92 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  25.64 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  27.7 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  25 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0992  flagellin domain protein  26.71 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  29.56 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3618  flagellin  25.77 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000440531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  27.9 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0196  flagellin domain-containing protein  29.43 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1582  flagellin domain-containing protein  25 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3455  flagellin domain-containing protein  28.42 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  24.44 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  34.71 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  26.1 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  25.38 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  28.57 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>