154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0677 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  63.77 
 
 		 592 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  100 
 
 		 585 aa  1122    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  61.17 
 
 		 590 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  42.53 
 
 		 582 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  60.62 
 
 		 439 aa  349  7e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  62.01 
 
 		 461 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  58.33 
 
 		 494 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  59.88 
 
 		 461 aa  330  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  56.83 
 
 		 311 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  43.72 
 
 		 395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  42.33 
 
 		 395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  45.3 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  50.31 
 
 		 303 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  49.7 
 
 		 302 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  49.08 
 
 		 303 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  44.13 
 
 		 320 aa  157  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  43.96 
 
 		 320 aa  157  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  42.21 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  44.51 
 
 		 320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  49.69 
 
 		 302 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  43.41 
 
 		 320 aa  154  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  48.5 
 
 		 302 aa  150  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  42.86 
 
 		 320 aa  150  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  48.5 
 
 		 302 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  45 
 
 		 389 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  46.63 
 
 		 301 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  46.01 
 
 		 301 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  46.11 
 
 		 311 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2814  flagellin domain protein  38.6 
 
 		 332 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2555  flagellin domain protein  38.6 
 
 		 332 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  40 
 
 		 293 aa  130  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  41.97 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  40.32 
 
 		 321 aa  128  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  43.04 
 
 		 282 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  43.04 
 
 		 269 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  47.41 
 
 		 289 aa  120  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0331  flagellin domain protein  37.89 
 
 		 320 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0363  flagellin domain protein  36.65 
 
 		 320 aa  110  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0920574  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  41.21 
 
 		 292 aa  107  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  35.75 
 
 		 364 aa  107  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  38.65 
 
 		 516 aa  104  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  44.57 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  41.67 
 
 		 522 aa  99.4  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  38.69 
 
 		 328 aa  96.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  40.34 
 
 		 380 aa  90.1  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3219  flagella associated protein  39.83 
 
 		 319 aa  87.4  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  35.77 
 
 		 292 aa  87.4  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  33.33 
 
 		 281 aa  86.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  38.51 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  38.51 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  34.31 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  50 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  50 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  34.76 
 
 		 284 aa  82.8  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  33.33 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  34.31 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  39.17 
 
 		 277 aa  76.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  35.76 
 
 		 277 aa  75.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  36.67 
 
 		 279 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  42.05 
 
 		 274 aa  72  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  52.86 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  50 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  41.38 
 
 		 275 aa  69.7  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  35.88 
 
 		 282 aa  66.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  38.64 
 
 		 274 aa  63.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  38.39 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  31.91 
 
 		 692 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6502  hypothetical protein  36.81 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  30.77 
 
 		 620 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  30.77 
 
 		 1562 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  29.79 
 
 		 693 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  30.83 
 
 		 289 aa  54.3  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0108  flagellin domain-containing protein  42.65 
 
 		 294 aa  53.9  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  30.85 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  30.77 
 
 		 630 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2158  flagellin  25.17 
 
 		 579 aa  52  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  30.85 
 
 		 399 aa  52  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  34.07 
 
 		 405 aa  52  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  28.99 
 
 		 517 aa  51.6  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0670  flagellin domain protein  31.5 
 
 		 780 aa  51.6  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  26.59 
 
 		 319 aa  51.6  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  29.93 
 
 		 383 aa  51.2  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  34.52 
 
 		 405 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  29.41 
 
 		 377 aa  50.4  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0151  flagellin domain-containing protein  29.19 
 
 		 516 aa  50.4  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.382062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  29.79 
 
 		 399 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  28.57 
 
 		 572 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  30 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  27.75 
 
 		 319 aa  50.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  29.18 
 
 		 375 aa  50.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  32.97 
 
 		 405 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  32.97 
 
 		 405 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2989  flagellin  30.69 
 
 		 272 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000626303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  33.33 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2876  flagellin-like  34.52 
 
 		 282 aa  49.7  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  28.89 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  32.97 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2200  flagellin FliC  25.15 
 
 		 587 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  29.92 
 
 		 265 aa  48.9  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3850  flagellin domain-containing protein  32.76 
 
 		 502 aa  48.9  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>