108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2501 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  93.09 
 
 		 405 aa  664    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  748    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  99.75 
 
 		 405 aa  746    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  94.07 
 
 		 405 aa  674    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  94.32 
 
 		 405 aa  660    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  62.29 
 
 		 399 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  61.8 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  62.29 
 
 		 399 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  60.15 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  60.83 
 
 		 400 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  50.69 
 
 		 420 aa  349  6e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  41.05 
 
 		 393 aa  249  7e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  43.56 
 
 		 432 aa  247  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  40.38 
 
 		 375 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  51.69 
 
 		 737 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  58.01 
 
 		 620 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  58.01 
 
 		 693 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  57.63 
 
 		 762 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  55.8 
 
 		 630 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  53.08 
 
 		 522 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  58.76 
 
 		 892 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  54.24 
 
 		 735 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  45.27 
 
 		 514 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  57.63 
 
 		 886 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  53.65 
 
 		 692 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  57.22 
 
 		 528 aa  176  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  48.95 
 
 		 1562 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  52.53 
 
 		 516 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  57.06 
 
 		 886 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  52.05 
 
 		 523 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  56.5 
 
 		 536 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  55.87 
 
 		 888 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  55.93 
 
 		 523 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  55.93 
 
 		 753 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  54.8 
 
 		 537 aa  170  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  53.67 
 
 		 888 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  52.46 
 
 		 578 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  49.18 
 
 		 572 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  70.71 
 
 		 746 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  38.86 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  39.9 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  39.38 
 
 		 272 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  37.82 
 
 		 272 aa  113  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  37.82 
 
 		 272 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  37.82 
 
 		 272 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  36.73 
 
 		 275 aa  110  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  38.81 
 
 		 300 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  37.3 
 
 		 289 aa  106  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  38.86 
 
 		 275 aa  106  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  43.16 
 
 		 547 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  31.32 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  32.39 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  26.85 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  25.68 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  29.09 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  25.68 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  29.71 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  26.9 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  31.25 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  31.34 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  31.71 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  28.81 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  38.61 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  26.63 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  24.12 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  29.19 
 
 		 274 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  28.74 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  36.63 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  35.06 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  27.27 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  27.59 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  28.41 
 
 		 275 aa  57  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  32.78 
 
 		 289 aa  57  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  32.98 
 
 		 320 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  30.08 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  35.16 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  26.9 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  25.25 
 
 		 303 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  27.96 
 
 		 277 aa  53.9  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  36.36 
 
 		 395 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  25.38 
 
 		 301 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  29.03 
 
 		 321 aa  53.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  36.36 
 
 		 311 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  25.13 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  35.06 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  32.97 
 
 		 585 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  33.7 
 
 		 292 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  35.06 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  25 
 
 		 279 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  23.04 
 
 		 282 aa  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  31.18 
 
 		 590 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  23.37 
 
 		 281 aa  47  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  26.82 
 
 		 293 aa  47  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  25.26 
 
 		 279 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  29.86 
 
 		 516 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  25.26 
 
 		 279 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  26.2 
 
 		 278 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 		 327 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  29.67 
 
 		 592 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  37.66 
 
 		 311 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>