106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1246 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  758    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  88.72 
 
 		 399 aa  678    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  90.23 
 
 		 397 aa  663    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  91.23 
 
 		 399 aa  696    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  79.75 
 
 		 400 aa  587  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  61.65 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  60.92 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  60.92 
 
 		 405 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  61.65 
 
 		 405 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  60.19 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  52.27 
 
 		 420 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  48.77 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  44.25 
 
 		 393 aa  259  7e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  43.92 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  58.01 
 
 		 578 aa  192  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  54.5 
 
 		 1562 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  56.04 
 
 		 620 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  55.8 
 
 		 572 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  50.5 
 
 		 693 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  49.5 
 
 		 630 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  48.5 
 
 		 692 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  52.78 
 
 		 762 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  54.19 
 
 		 892 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  54.19 
 
 		 888 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  45.92 
 
 		 523 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  52.51 
 
 		 888 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  52.25 
 
 		 886 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  53.37 
 
 		 528 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  51.69 
 
 		 886 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  51.4 
 
 		 737 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  55.31 
 
 		 746 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  52.81 
 
 		 514 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  49.72 
 
 		 753 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  51.69 
 
 		 522 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  51.69 
 
 		 516 aa  156  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  49.16 
 
 		 523 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  49.16 
 
 		 536 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  50.84 
 
 		 735 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  49.16 
 
 		 537 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  44.69 
 
 		 272 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  43.01 
 
 		 272 aa  119  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  41.08 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  41.08 
 
 		 272 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  40 
 
 		 272 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  42.13 
 
 		 300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  41.08 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  38.04 
 
 		 289 aa  106  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  38.83 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  38.1 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  42.48 
 
 		 547 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  33.87 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  29.21 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  28.36 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  29.7 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  30.2 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  30.05 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  28.64 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  29.61 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  28.36 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  24.7 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  28.94 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  35.11 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  34.27 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  31.3 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  33.71 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  32.4 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  35.11 
 
 		 320 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  43.04 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  35.11 
 
 		 320 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  31.21 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  36.17 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  37.89 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  25.95 
 
 		 274 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  36.63 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  36.36 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  35.87 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  30.81 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  30.16 
 
 		 274 aa  57  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  28.09 
 
 		 277 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  30.91 
 
 		 273 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  26.53 
 
 		 282 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  43.59 
 
 		 289 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  31.47 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  37.66 
 
 		 311 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  30.85 
 
 		 585 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  28.07 
 
 		 282 aa  50.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  31.08 
 
 		 516 aa  50.1  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  37.1 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  31.01 
 
 		 292 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  26.78 
 
 		 281 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  29.95 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  29.67 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  25.91 
 
 		 282 aa  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0101  flagellin domain protein  29.19 
 
 		 273 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  29.09 
 
 		 439 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  41.89 
 
 		 522 aa  46.6  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  24.74 
 
 		 364 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  29.79 
 
 		 592 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  36.25 
 
 		 389 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  43.66 
 
 		 293 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>