More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0266 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  91.9 
 
 		 395 aa  689    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  100 
 
 		 395 aa  775    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  74.75 
 
 		 395 aa  555  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  48.87 
 
 		 321 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  59.58 
 
 		 302 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  59.34 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  70.79 
 
 		 303 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  59.17 
 
 		 302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  64.97 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  70.22 
 
 		 302 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  64.06 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  66.29 
 
 		 301 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  59.36 
 
 		 320 aa  215  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  59.89 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  59.89 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  58.82 
 
 		 320 aa  209  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  57.75 
 
 		 320 aa  209  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  68.54 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0331  flagellin domain protein  36.2 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0363  flagellin domain protein  36.59 
 
 		 320 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0920574  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2814  flagellin domain protein  51.76 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2555  flagellin domain protein  50.87 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  50 
 
 		 311 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  47.12 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  42.21 
 
 		 585 aa  157  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  44.75 
 
 		 592 aa  157  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  47.31 
 
 		 461 aa  156  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  47.31 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  39.58 
 
 		 494 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  48.04 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  56.62 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  47.34 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  31.3 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  38.5 
 
 		 590 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  48.81 
 
 		 282 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  48.81 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3219  flagella associated protein  40.22 
 
 		 319 aa  130  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  42.26 
 
 		 516 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  60 
 
 		 389 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  44.09 
 
 		 292 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  39.63 
 
 		 522 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  39.88 
 
 		 281 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  39.34 
 
 		 282 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  40.46 
 
 		 282 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  40 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  39.29 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  37.8 
 
 		 582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  40.48 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  38.73 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  43.07 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  36.79 
 
 		 281 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  36.79 
 
 		 281 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  59.14 
 
 		 439 aa  100  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  35.47 
 
 		 284 aa  93.6  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  46.36 
 
 		 273 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  47.27 
 
 		 273 aa  91.3  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  37.96 
 
 		 274 aa  90.5  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  45 
 
 		 277 aa  89.7  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  35.51 
 
 		 274 aa  86.7  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  26.62 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  47.27 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  47.73 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  40.23 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  51.39 
 
 		 272 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  24.26 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  45.35 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2876  flagellin-like  32.64 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  25.91 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  30.19 
 
 		 282 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1811  flagellin domain-containing protein  25.3 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.340499  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  42.7 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  34.71 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1476  flagellin domain-containing protein  31.91 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  25.72 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  31.21 
 
 		 475 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  27.06 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  31.25 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  34.75 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0670  flagellin domain protein  30.37 
 
 		 780 aa  63.5  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  24.35 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0168  flagellin domain-containing protein  30.71 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  30.51 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  29.08 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0198  flagellin-like protein  30.37 
 
 		 936 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  34.41 
 
 		 693 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  32.62 
 
 		 265 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  29.55 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  33.33 
 
 		 692 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  25.99 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  27.94 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  22.71 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1636  flagellin B  33.79 
 
 		 518 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004160  flagellin protein flaE  25.55 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000739786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  24.76 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  28.68 
 
 		 516 aa  60.1  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1528  flagellin  30.28 
 
 		 573 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1339  flagellin  30.07 
 
 		 576 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  36.63 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0372  flagellin  29.58 
 
 		 573 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  36.63 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>