292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0751 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  100 
 
 		 320 aa  630  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  91.56 
 
 		 320 aa  554  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  90.94 
 
 		 320 aa  548  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  85.94 
 
 		 320 aa  520  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  65.31 
 
 		 320 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  58.57 
 
 		 321 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  52.94 
 
 		 303 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  51.54 
 
 		 303 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  44.56 
 
 		 395 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  52.48 
 
 		 301 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  51.85 
 
 		 302 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  53.89 
 
 		 301 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  51.88 
 
 		 302 aa  291  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  51.56 
 
 		 302 aa  288  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  50 
 
 		 311 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  51.25 
 
 		 302 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0363  flagellin domain protein  43.44 
 
 		 320 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0920574  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  43.87 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0331  flagellin domain protein  43.12 
 
 		 320 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  50.15 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2814  flagellin domain protein  46.01 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2555  flagellin domain protein  44.79 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3219  flagella associated protein  42.23 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  60.43 
 
 		 395 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  45.17 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  43.61 
 
 		 289 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  57.75 
 
 		 395 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  40.19 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  40.76 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  38.82 
 
 		 328 aa  192  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  48.28 
 
 		 592 aa  172  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  49.7 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  39.32 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  33.79 
 
 		 364 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  42.54 
 
 		 461 aa  155  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  44.51 
 
 		 585 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  43.2 
 
 		 461 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  44.44 
 
 		 590 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  31.56 
 
 		 282 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  45.24 
 
 		 494 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  33.85 
 
 		 282 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  34.69 
 
 		 279 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  31.25 
 
 		 281 aa  142  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  30.94 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  28.88 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  32.19 
 
 		 277 aa  139  7.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  30.43 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  30.98 
 
 		 273 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  30.09 
 
 		 281 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  30.98 
 
 		 273 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  32.19 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  28.48 
 
 		 274 aa  125  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  38.46 
 
 		 582 aa  123  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  28.79 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  29.81 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  30.67 
 
 		 273 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  40.84 
 
 		 269 aa  119  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  31.15 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  31.15 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  54.74 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  36.9 
 
 		 516 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  35.76 
 
 		 522 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2876  flagellin-like  28.31 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  38.71 
 
 		 389 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  30.09 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  35.21 
 
 		 380 aa  91.3  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  55.71 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  26.92 
 
 		 289 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  29.05 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2534  flagellin-like  26.73 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0108  flagellin domain-containing protein  27.19 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  23.89 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  24.84 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  24.84 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  26.38 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  25.69 
 
 		 393 aa  65.9  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  24.01 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  34.74 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  24.84 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  24.21 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  24.21 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  26.01 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  23.31 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  37.23 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  35 
 
 		 630 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  26.27 
 
 		 578 aa  62.8  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  24.04 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  36.17 
 
 		 397 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  29.8 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  31.91 
 
 		 693 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  36.17 
 
 		 399 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  23.9 
 
 		 271 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  36.17 
 
 		 399 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  30.85 
 
 		 692 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  24.85 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  23.91 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  31.18 
 
 		 620 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0196  flagellin domain-containing protein  22.74 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  23.2 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  35.23 
 
 		 537 aa  59.7  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>