130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0238 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  100 
 
 
432 aa  821    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  48.86 
 
 
399 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  48.77 
 
 
399 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  48.53 
 
 
400 aa  279  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  48.77 
 
 
399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  45.37 
 
 
420 aa  269  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  44 
 
 
405 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  44.17 
 
 
405 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  45.8 
 
 
397 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  43.95 
 
 
405 aa  251  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  43.27 
 
 
405 aa  246  6e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  43.27 
 
 
405 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  39.95 
 
 
393 aa  216  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  49.28 
 
 
693 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  52.84 
 
 
620 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  48.31 
 
 
692 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  52.84 
 
 
1562 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  55.31 
 
 
886 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  53.37 
 
 
630 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  54.3 
 
 
528 aa  160  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  44.01 
 
 
762 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  52.25 
 
 
886 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  41.7 
 
 
737 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  52 
 
 
892 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  50.86 
 
 
888 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  52.54 
 
 
523 aa  149  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  50.29 
 
 
888 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  42.55 
 
 
735 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  51.41 
 
 
753 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  49.44 
 
 
536 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  49.46 
 
 
523 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  50.28 
 
 
522 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  49.72 
 
 
516 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  50.85 
 
 
375 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  48.9 
 
 
572 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  51.12 
 
 
537 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  49.74 
 
 
578 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  42.76 
 
 
746 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  38.8 
 
 
289 aa  117  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  55.12 
 
 
514 aa  116  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  42.25 
 
 
272 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  42.46 
 
 
272 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  40.1 
 
 
300 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  39.55 
 
 
272 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  39.43 
 
 
272 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  39.43 
 
 
272 aa  103  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  39.55 
 
 
272 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  40.34 
 
 
275 aa  99.8  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  39.38 
 
 
275 aa  94.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  44.66 
 
 
547 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  32.02 
 
 
273 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  34.64 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  30.98 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  33.71 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  31.87 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  31.35 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  35.11 
 
 
289 aa  67  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  34.74 
 
 
320 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  34.74 
 
 
320 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  33.71 
 
 
272 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  32.75 
 
 
273 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  32.22 
 
 
279 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  27.78 
 
 
302 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  34.74 
 
 
320 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  34.74 
 
 
320 aa  63.2  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  27.41 
 
 
302 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  36.15 
 
 
395 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  31.32 
 
 
282 aa  62.4  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  28.22 
 
 
302 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  37.04 
 
 
395 aa  60.1  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  37.14 
 
 
321 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  35.71 
 
 
389 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  37.36 
 
 
301 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  34.17 
 
 
380 aa  58.2  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  26.24 
 
 
302 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  30.77 
 
 
277 aa  56.6  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  34.52 
 
 
311 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  26.78 
 
 
320 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  27.86 
 
 
301 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  27.52 
 
 
271 aa  54.3  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  28.25 
 
 
271 aa  54.7  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  30.34 
 
 
276 aa  53.9  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  30.46 
 
 
292 aa  53.9  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  34.07 
 
 
292 aa  53.5  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  31.76 
 
 
303 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  31.43 
 
 
516 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  32.65 
 
 
439 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  36.11 
 
 
327 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0315  flagellin domain-containing protein  27.72 
 
 
278 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  27.96 
 
 
277 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  36.11 
 
 
303 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  27.35 
 
 
271 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  27.63 
 
 
271 aa  50.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  27.63 
 
 
271 aa  50.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  35.44 
 
 
389 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 
585 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  30.65 
 
 
278 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  30.15 
 
 
278 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  32.8 
 
 
293 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  37.5 
 
 
328 aa  47.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>