More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3922 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  100 
 
 		 389 aa  798    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4248  AMP-dependent synthetase and ligase  89.92 
 
 		 636 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  63.71 
 
 		 641 aa  348  8e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.646779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1183  AMP-dependent synthetase and ligase  59.3 
 
 		 636 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.918913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0943  putative propionate--CoA ligase  61.72 
 
 		 634 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  61.92 
 
 		 635 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2464  AMP-dependent synthetase and ligase  59.69 
 
 		 638 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1673  propionate--CoA ligase  57.75 
 
 		 636 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4326  AMP-dependent synthetase and ligase  59.39 
 
 		 636 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4996  AMP-dependent synthetase and ligase  59.3 
 
 		 636 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4221  AMP-dependent synthetase and ligase  58.24 
 
 		 636 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409374  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_004310  BR1731  propionate--CoA ligase  57.36 
 
 		 636 aa  325  8.000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3748  AMP-dependent synthetase and ligase  59.02 
 
 		 641 aa  324  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.159285  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  59.38 
 
 		 632 aa  322  6e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.471619  hitchhiker  0.000000265688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  63.67 
 
 		 641 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1067  AMP-dependent synthetase and ligase  60.55 
 
 		 642 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1779  AMP-dependent synthetase and ligase  58.24 
 
 		 631 aa  316  5e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489551  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2298  AMP-dependent synthetase and ligase  60.55 
 
 		 633 aa  315  9.999999999999999e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.59059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6467  AMP-dependent synthetase and ligase  57.48 
 
 		 627 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4396  AMP-dependent synthetase and ligase  57.42 
 
 		 636 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1958  AMP-dependent synthetase and ligase  57.92 
 
 		 643 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2234  AMP-dependent synthetase and ligase  58.3 
 
 		 643 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.573086 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1511  propionate--CoA ligase  56.47 
 
 		 634 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.919396  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1913  AMP-dependent synthetase and ligase  58.3 
 
 		 640 aa  297  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.633526 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1046  AMP-dependent synthetase and ligase  49.04 
 
 		 634 aa  296  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1890  propionate--CoA ligase  56.69 
 
 		 695 aa  296  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.964967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1288  propionate--CoA ligase  53.28 
 
 		 631 aa  293  3e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1125  propionate--CoA ligase  55.74 
 
 		 640 aa  292  6e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1575  AMP-dependent synthetase and ligase  56.08 
 
 		 627 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0872  AMP-dependent synthetase and ligase  54.05 
 
 		 640 aa  290  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1176  AMP-dependent synthetase and ligase  54.05 
 
 		 631 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  54.51 
 
 		 637 aa  290  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.313288  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  55.73 
 
 		 630 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  53.91 
 
 		 623 aa  289  7e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0878  AMP-dependent synthetase and ligase  53.28 
 
 		 631 aa  288  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000235453  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0956  propionate--CoA ligase  49.82 
 
 		 632 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2043  AMP-dependent synthetase and ligase  53.15 
 
 		 638 aa  287  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0081773  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1959  AMP-dependent synthetase and ligase  52.34 
 
 		 639 aa  286  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330038  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1171  AMP-dependent synthetase and ligase  53.28 
 
 		 640 aa  286  4e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.263452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2568  AMP-dependent synthetase and ligase  53.1 
 
 		 662 aa  286  5e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1574  AMP-dependent synthetase and ligase  54.72 
 
 		 630 aa  285  7e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2319  AMP-dependent synthetase and ligase  47.97 
 
 		 635 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2391  AMP-dependent synthetase and ligase  47.97 
 
 		 640 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.977158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4231  AMP-dependent synthetase and ligase  54.09 
 
 		 625 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1499  AMP-dependent synthetase and ligase  54.05 
 
 		 635 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4297  AMP-dependent synthetase and ligase  54.09 
 
 		 625 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0348009  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4609  AMP-dependent synthetase and ligase  54.09 
 
 		 625 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02248  Propionyl CoA synthase  51.69 
 
 		 636 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.267498  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1675  AMP-dependent synthetase and ligase  47.64 
 
 		 640 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  54.51 
 
 		 629 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2622  AMP-dependent synthetase and ligase  52.9 
 
 		 642 aa  280  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32550  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  52.11 
 
 		 644 aa  280  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2351  acetyl-CoA synthetase, putative  53.54 
 
 		 629 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1460  AMP-dependent synthetase and ligase  51.18 
 
 		 638 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1364  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase  52.85 
 
 		 644 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1396  AMP-dependent synthetase and ligase  48.42 
 
 		 632 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.792119  normal  0.172808 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2225  AMP-dependent synthetase and ligase  51.97 
 
 		 634 aa  277  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1532  AMP-dependent synthetase and ligase  53.75 
 
 		 652 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.589921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  53.75 
 
 		 652 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.420562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1951  AMP-dependent synthetase and ligase  54.12 
 
 		 629 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419294 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003392  propionate--CoA ligase  50.79 
 
 		 625 aa  276  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02393  hypothetical protein  50.78 
 
 		 626 aa  276  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2844  AMP-dependent synthetase and ligase  53.75 
 
 		 652 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3221  AMP-dependent synthetase and ligase  51.18 
 
 		 640 aa  275  9e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0171767 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1721  AMP-dependent synthetase and ligase  52.92 
 
 		 652 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0917  acid-CoA ligase family protein  50.21 
 
 		 631 aa  274  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1730  AMP-dependent synthetase and ligase  48.64 
 
 		 624 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000665124  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0613  AMP-dependent synthetase and ligase  50.97 
 
 		 643 aa  273  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2795  AMP-dependent synthetase and ligase  52.67 
 
 		 634 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1592  acyl-CoA sythetase  48.65 
 
 		 638 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2393  AMP-dependent synthetase and ligase  55.74 
 
 		 627 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000718613  hitchhiker  0.000862635 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0273  AMP-dependent synthetase and ligase  49.48 
 
 		 630 aa  272  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2826  AMP-dependent synthetase and ligase  53.33 
 
 		 652 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0245  AMP-dependent synthetase and ligase  48.79 
 
 		 630 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1797  AMP-dependent synthetase and ligase  52.76 
 
 		 641 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10660  acetyl-CoA synthetase  53.15 
 
 		 629 aa  270  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2725  AMP-dependent synthetase and ligase  50.82 
 
 		 638 aa  269  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0122187  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1791  AMP-dependent synthetase and ligase  51.18 
 
 		 629 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.223336 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1865  AMP-dependent synthetase and ligase  49.61 
 
 		 628 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.610194  normal  0.170173 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0012  AMP-dependent synthetase and ligase  48.59 
 
 		 634 aa  269  7e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2203  propionyl-CoA synthetase  48.73 
 
 		 629 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2671  AMP-dependent synthetase and ligase  52.38 
 
 		 624 aa  262  6.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1576  putative acetyl-coa synthetase  51.18 
 
 		 628 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18150  putative acetyl-coa synthetase  51.57 
 
 		 628 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  85.09 
 
 		 311 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2185  propionyl-CoA synthetase  46.48 
 
 		 630 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238065  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1689  propionyl-CoA synthetase  50.58 
 
 		 636 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  54.33 
 
 		 626 aa  256  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135947  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2513  propionyl-CoA synthetase  46.32 
 
 		 631 aa  256  6e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3790  AMP-dependent synthetase and ligase  49.61 
 
 		 633 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.20899  decreased coverage  0.0016859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0395  propionyl-CoA synthetase  45.96 
 
 		 631 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3965  propionyl-CoA synthetase  48.35 
 
 		 628 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123935 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14120  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  53.08 
 
 		 651 aa  249  6e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0156514  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2170  propionyl-CoA synthetase  43.62 
 
 		 637 aa  249  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0671437  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1729  propionyl-CoA synthetase  44.37 
 
 		 633 aa  245  9e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264678  normal  0.844585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2633  propionyl-CoA synthetase  44.65 
 
 		 641 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1562  propionyl-CoA synthetase  46.06 
 
 		 625 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1825  propionyl-CoA synthetase  44.81 
 
 		 631 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2016  propionyl-CoA synthetase  44.81 
 
 		 631 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.143176  normal  0.377009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1518  propionyl-CoA synthetase  47.29 
 
 		 632 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>