34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6502 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6502  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  862    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6503  hypothetical protein  57.48 
 
 		 414 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0691  protein of unknown function DUF1217  56.1 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0654  protein of unknown function DUF1217  54.46 
 
 		 417 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0680  hypothetical protein  55.16 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4216  hypothetical protein  55.14 
 
 		 264 aa  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.338964  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0969  hypothetical protein  53.27 
 
 		 727 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.685924  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0251  hypothetical protein  53.27 
 
 		 259 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00748902  normal  0.467575 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2474  hypothetical protein  52.68 
 
 		 801 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.958646 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0118  hypothetical protein  55.14 
 
 		 262 aa  126  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0127  hypothetical protein  55.88 
 
 		 258 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0302  hypothetical protein  50.47 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202407  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0545  protein of unknown function DUF1217  48.11 
 
 		 1111 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000988824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0592  protein of unknown function DUF1217  49.06 
 
 		 1111 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.535986 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0479  hypothetical protein  49.53 
 
 		 822 aa  109  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5534  protein of unknown function DUF1217  50 
 
 		 738 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1710  hypothetical protein  48.31 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214563  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1147  hypothetical protein  49.06 
 
 		 264 aa  108  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1655  protein of unknown function DUF1217  46.73 
 
 		 259 aa  107  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.939234 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2809  hypothetical protein  42.99 
 
 		 259 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.311131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5254  protein of unknown function DUF1217  50.52 
 
 		 727 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2971  hypothetical protein  43.04 
 
 		 650 aa  76.6  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.123475 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3881  flagellar basal-body rod protein FLGF  35.29 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0287836  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4159  hypothetical protein  35.29 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0365541  normal  0.446399 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4200  flagellar protein, putative  32.79 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.628591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3358  protein of unknown function DUF1217  36.84 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  36.71 
 
 		 582 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1618  flagellar protein, putative  27.93 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  35.07 
 
 		 590 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  36.81 
 
 		 585 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  39.6 
 
 		 439 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0105  hypothetical protein  28.85 
 
 		 290 aa  49.7  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3449  hypothetical protein  34.07 
 
 		 281 aa  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.419129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  41.03 
 
 		 592 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>