27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3449 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3449  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  560  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.419129 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4216  hypothetical protein  26.18 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.338964  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0118  hypothetical protein  26.61 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0127  hypothetical protein  26.61 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0105  hypothetical protein  27.5 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0545  protein of unknown function DUF1217  27.95 
 
 		 1111 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000988824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0592  protein of unknown function DUF1217  27.75 
 
 		 1111 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.535986 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2809  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.311131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0302  hypothetical protein  23.26 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202407  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1655  protein of unknown function DUF1217  30 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.939234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2474  hypothetical protein  23.79 
 
 		 801 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.958646 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4159  hypothetical protein  24.32 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0365541  normal  0.446399 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0251  hypothetical protein  21.67 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00748902  normal  0.467575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6503  hypothetical protein  27.97 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3881  flagellar basal-body rod protein FLGF  23.78 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0287836  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0969  hypothetical protein  24.15 
 
 		 727 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.685924  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1710  hypothetical protein  27.69 
 
 		 472 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214563  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4200  flagellar protein, putative  25.54 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.628591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0691  protein of unknown function DUF1217  28.35 
 
 		 417 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0479  hypothetical protein  22.01 
 
 		 822 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0680  hypothetical protein  28.35 
 
 		 417 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0654  protein of unknown function DUF1217  26.67 
 
 		 417 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5534  protein of unknown function DUF1217  26.32 
 
 		 738 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6502  hypothetical protein  34.07 
 
 		 429 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315608 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5254  protein of unknown function DUF1217  27.54 
 
 		 727 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2971  hypothetical protein  23.88 
 
 		 650 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.123475 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1147  hypothetical protein  20.87 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>