34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6503 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6503  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  810    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0654  protein of unknown function DUF1217  62.74 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0691  protein of unknown function DUF1217  63.25 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0680  hypothetical protein  62.05 
 
 		 417 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6502  hypothetical protein  58.14 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0969  hypothetical protein  59.46 
 
 		 727 aa  146  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.685924  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4216  hypothetical protein  53.17 
 
 		 264 aa  143  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.338964  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0118  hypothetical protein  53.17 
 
 		 262 aa  142  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2474  hypothetical protein  60.18 
 
 		 801 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.958646 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0127  hypothetical protein  53.72 
 
 		 258 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0302  hypothetical protein  55.14 
 
 		 258 aa  137  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202407  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0479  hypothetical protein  56.76 
 
 		 822 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1655  protein of unknown function DUF1217  55.37 
 
 		 259 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.939234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0251  hypothetical protein  51.75 
 
 		 259 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00748902  normal  0.467575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1710  hypothetical protein  30.79 
 
 		 472 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214563  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0545  protein of unknown function DUF1217  53.47 
 
 		 1111 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000988824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0592  protein of unknown function DUF1217  54.55 
 
 		 1111 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.535986 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5534  protein of unknown function DUF1217  58.49 
 
 		 738 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5254  protein of unknown function DUF1217  59.79 
 
 		 727 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2809  hypothetical protein  43.86 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.311131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1147  hypothetical protein  46.23 
 
 		 264 aa  97.1  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4200  flagellar protein, putative  41.35 
 
 		 265 aa  82.8  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.628591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3881  flagellar basal-body rod protein FLGF  39.42 
 
 		 262 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0287836  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4159  hypothetical protein  39.42 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0365541  normal  0.446399 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2971  hypothetical protein  38.1 
 
 		 650 aa  69.3  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.123475 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3358  protein of unknown function DUF1217  37.5 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0105  hypothetical protein  32.41 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1618  flagellar protein, putative  28.85 
 
 		 264 aa  59.7  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3449  hypothetical protein  27.74 
 
 		 281 aa  57  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.419129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  34.15 
 
 		 592 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  34.68 
 
 		 590 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  37.25 
 
 		 585 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  39.05 
 
 		 582 aa  43.1  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 		 439 aa  43.5  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>