32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0691 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0691  protein of unknown function DUF1217  100 
 
 
417 aa  817    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0654  protein of unknown function DUF1217  88.73 
 
 
417 aa  727    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0680  hypothetical protein  96.88 
 
 
417 aa  765    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6503  hypothetical protein  62.44 
 
 
414 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6502  hypothetical protein  56.1 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315608 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4216  hypothetical protein  57.38 
 
 
264 aa  143  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.338964  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0969  hypothetical protein  30.11 
 
 
727 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.685924  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0118  hypothetical protein  56.56 
 
 
262 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2474  hypothetical protein  60.71 
 
 
801 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.958646 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0127  hypothetical protein  55.93 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0251  hypothetical protein  54.1 
 
 
259 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00748902  normal  0.467575 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0545  protein of unknown function DUF1217  56 
 
 
1111 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000988824  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1710  hypothetical protein  50.75 
 
 
472 aa  126  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214563  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0592  protein of unknown function DUF1217  54.46 
 
 
1111 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.535986 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0302  hypothetical protein  47.97 
 
 
258 aa  122  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202407  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5534  protein of unknown function DUF1217  48.61 
 
 
738 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0479  hypothetical protein  52.46 
 
 
822 aa  117  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1655  protein of unknown function DUF1217  50.94 
 
 
259 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.939234 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5254  protein of unknown function DUF1217  55.67 
 
 
727 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1147  hypothetical protein  45.83 
 
 
264 aa  100  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2809  hypothetical protein  42.06 
 
 
259 aa  99.8  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.311131  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4200  flagellar protein, putative  37.1 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.628591  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3881  flagellar basal-body rod protein FLGF  40.4 
 
 
262 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0287836  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4159  hypothetical protein  40.4 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0365541  normal  0.446399 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2971  hypothetical protein  37.08 
 
 
650 aa  73.9  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.123475 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3358  protein of unknown function DUF1217  38.75 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1618  flagellar protein, putative  35.62 
 
 
264 aa  54.7  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0105  hypothetical protein  30.16 
 
 
290 aa  53.5  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  43.88 
 
 
582 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3449  hypothetical protein  28.35 
 
 
281 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.419129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  31.01 
 
 
590 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  41.33 
 
 
592 aa  43.5  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>