76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0242 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  100 
 
 
582 aa  1141    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  42.53 
 
 
585 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  43.09 
 
 
590 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  43.09 
 
 
592 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  47 
 
 
461 aa  243  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  49.31 
 
 
439 aa  243  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  49.15 
 
 
461 aa  240  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  47.65 
 
 
494 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  48.62 
 
 
311 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  39.78 
 
 
320 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  39.64 
 
 
320 aa  130  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  41.99 
 
 
389 aa  128  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  40.36 
 
 
395 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  37.89 
 
 
321 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  38.46 
 
 
320 aa  125  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  42.34 
 
 
395 aa  124  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  44.78 
 
 
303 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  38.46 
 
 
320 aa  124  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  44.03 
 
 
302 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  44.78 
 
 
303 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  45.52 
 
 
302 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  38.89 
 
 
302 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  44.78 
 
 
302 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  36.09 
 
 
320 aa  118  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  42.54 
 
 
301 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  38.04 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  41.79 
 
 
301 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  38.46 
 
 
293 aa  113  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  43.7 
 
 
289 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  42.54 
 
 
311 aa  104  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2814  flagellin domain protein  30.2 
 
 
332 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2555  flagellin domain protein  29.41 
 
 
332 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  33.86 
 
 
327 aa  100  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  37.5 
 
 
282 aa  92.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0363  flagellin domain protein  32.24 
 
 
320 aa  92.8  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0920574  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  34.12 
 
 
321 aa  91.3  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  37.5 
 
 
269 aa  90.9  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0331  flagellin domain protein  30.26 
 
 
320 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  32.02 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  31.67 
 
 
292 aa  79  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  29.63 
 
 
516 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  31.39 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  35 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  28.81 
 
 
281 aa  72.4  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 
281 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  33.33 
 
 
281 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  29.63 
 
 
282 aa  72  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  28.47 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  29.2 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  33.33 
 
 
389 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3219  flagella associated protein  31.67 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  39.78 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  40.23 
 
 
275 aa  65.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  43.04 
 
 
277 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  40.91 
 
 
522 aa  63.9  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  28.47 
 
 
284 aa  62.4  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  40.48 
 
 
274 aa  62.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  49.21 
 
 
279 aa  62.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6502  hypothetical protein  36.71 
 
 
429 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315608 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  35.14 
 
 
274 aa  60.5  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  38.55 
 
 
277 aa  60.1  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  31.69 
 
 
273 aa  57.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  51.11 
 
 
272 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0654  protein of unknown function DUF1217  45.1 
 
 
417 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  38.55 
 
 
282 aa  55.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 
273 aa  55.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2876  flagellin-like  32.08 
 
 
282 aa  53.5  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  31.46 
 
 
327 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  27.27 
 
 
692 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  32.14 
 
 
273 aa  47.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  27.47 
 
 
693 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  30.77 
 
 
630 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  26.09 
 
 
289 aa  46.2  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  26.37 
 
 
620 aa  44.3  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0680  hypothetical protein  45.92 
 
 
417 aa  44.3  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  36.78 
 
 
572 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.999486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>