More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0267 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  100 
 
 		 395 aa  781    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  73.99 
 
 		 395 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  74.49 
 
 		 395 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  63.85 
 
 		 303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  71.75 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  66.34 
 
 		 302 aa  239  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  71.19 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  68.59 
 
 		 302 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  70.06 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  37.31 
 
 		 321 aa  226  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  64.92 
 
 		 301 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  36.91 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  66.67 
 
 		 301 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2555  flagellin domain protein  40 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  61.5 
 
 		 320 aa  216  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  59.14 
 
 		 320 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  59.68 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  68.36 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  59.14 
 
 		 320 aa  209  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  57.53 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  60 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0331  flagellin domain protein  36.36 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0363  flagellin domain protein  35.18 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0920574  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2814  flagellin domain protein  52.38 
 
 		 332 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  53.54 
 
 		 311 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3219  flagella associated protein  34.05 
 
 		 319 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  42.33 
 
 		 585 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  46.99 
 
 		 592 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  41.28 
 
 		 494 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  45.56 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  46.71 
 
 		 461 aa  154  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  45.08 
 
 		 327 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  48.24 
 
 		 293 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  56.62 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  41.5 
 
 		 590 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  47.98 
 
 		 282 aa  139  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  47.98 
 
 		 269 aa  138  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  42.42 
 
 		 516 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  63.55 
 
 		 389 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  40.36 
 
 		 582 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  43.78 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  41.67 
 
 		 328 aa  116  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  39.26 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  43.48 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  38.64 
 
 		 282 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  38.15 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  44.03 
 
 		 380 aa  111  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  42.04 
 
 		 281 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  41.3 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  39.13 
 
 		 281 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  39.13 
 
 		 281 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  35.43 
 
 		 284 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  34.27 
 
 		 364 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  37.23 
 
 		 274 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  32 
 
 		 274 aa  88.6  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  27.32 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  47.92 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  46.59 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  46.51 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  27.51 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  51.43 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  50.65 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  30.81 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  34.27 
 
 		 277 aa  76.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  30.43 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  43.82 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2876  flagellin-like  32.45 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1811  flagellin domain-containing protein  25.42 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.340499  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  34.38 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0539  flagellin domain-containing protein  26.64 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1478  flagellin domain-containing protein  26.1 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1476  flagellin domain-containing protein  27.92 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  25.18 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  24.48 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  24.48 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  30.99 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  30.14 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  35.21 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  34.56 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0198  flagellin-like protein  31.06 
 
 		 936 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  25.82 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  34.06 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  34.06 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0372  flagellin  26.05 
 
 		 573 aa  63.2  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0168  flagellin domain-containing protein  27.03 
 
 		 513 aa  63.2  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1636  flagellin B  30.34 
 
 		 518 aa  62.8  0.000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  32.87 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  30.11 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  24.41 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1635  flagellin B  27.47 
 
 		 519 aa  62  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  25.54 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1835  flagellin  29.59 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000180129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1757  flagellin  30.43 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0077  flagellin domain-containing protein  29.93 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104255 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1528  flagellin  26.05 
 
 		 573 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  37.89 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2873  flagellin  25.19 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3870  flagellin  25.19 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1671  flagellin  25.19 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>