More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1038 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  100 
 
 		 282 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  93.26 
 
 		 281 aa  491  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  85.11 
 
 		 282 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  77.66 
 
 		 292 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  74.82 
 
 		 281 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  53.19 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  53.19 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2876  flagellin-like  51.94 
 
 		 282 aa  253  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  55.32 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  48.96 
 
 		 516 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  56.07 
 
 		 522 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  40.13 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  38.25 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  38.08 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  36.1 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  34.62 
 
 		 302 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  34.62 
 
 		 301 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  35.87 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  36.83 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  36.88 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  36.22 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  40.83 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  36.84 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  34.44 
 
 		 321 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  36.48 
 
 		 311 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  35.76 
 
 		 274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  30.94 
 
 		 320 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  37.19 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  30.31 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  30 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  35.84 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  31.87 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  35.98 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  34.8 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  34.69 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  30.14 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  30.58 
 
 		 320 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  37.21 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  34.74 
 
 		 272 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  31.63 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  35.26 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  31.66 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  31.16 
 
 		 277 aa  125  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  41.04 
 
 		 395 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  40.46 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  38.64 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  37.61 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  32.41 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  35.84 
 
 		 380 aa  101  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  29.46 
 
 		 321 aa  99.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0363  flagellin domain protein  25.89 
 
 		 320 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0920574  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0331  flagellin domain protein  25.4 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2814  flagellin domain protein  27.91 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2555  flagellin domain protein  27.73 
 
 		 332 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3219  flagella associated protein  27.84 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  33.18 
 
 		 439 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  35.77 
 
 		 592 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  32.37 
 
 		 461 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  35.77 
 
 		 461 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  28.36 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  35.04 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  33.58 
 
 		 590 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  27.76 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  34.31 
 
 		 585 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  27.05 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  40.32 
 
 		 389 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  25.98 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  33.58 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0108  flagellin domain-containing protein  27.55 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  24.56 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  25.62 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  30.66 
 
 		 364 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  26.83 
 
 		 278 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  29.63 
 
 		 582 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  24.56 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2561  flagellin domain protein  29.21 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  24.56 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  26.13 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  26.83 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  25.44 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  25.51 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  26.13 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0623  flagellin domain protein  26.28 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  26.76 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  32.04 
 
 		 630 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  25.78 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  29.73 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  25.82 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0803  flagellin domain protein  26.3 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  26.4 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  26.49 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  25.44 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  27.21 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  27.27 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0151  flagellin domain-containing protein  31.39 
 
 		 516 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.382062 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  26.91 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  28.22 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  25.99 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0804  flagellin domain protein  26.3 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1004  flagellar filament core protein  26.9 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>