138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3830 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  100 
 
 
272 aa  529  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  94.85 
 
 
272 aa  498  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  94.49 
 
 
272 aa  494  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  93.38 
 
 
272 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  83.82 
 
 
272 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  84.19 
 
 
272 aa  448  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  58.7 
 
 
275 aa  293  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  57.61 
 
 
275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  57.58 
 
 
300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  41.05 
 
 
289 aa  188  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  42.15 
 
 
375 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  39.17 
 
 
393 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  45.96 
 
 
547 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  37.82 
 
 
420 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  45.51 
 
 
620 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  42.94 
 
 
630 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  44.63 
 
 
693 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  39.38 
 
 
405 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  41.62 
 
 
399 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  59.8 
 
 
572 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  41.08 
 
 
399 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  43.5 
 
 
692 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  57.84 
 
 
578 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  40.72 
 
 
737 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  38.92 
 
 
397 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  40.96 
 
 
886 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  39.29 
 
 
886 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  41.08 
 
 
399 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  37.82 
 
 
405 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  41.18 
 
 
753 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  37.31 
 
 
405 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  37.82 
 
 
405 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  39.52 
 
 
762 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  37.31 
 
 
405 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  38.55 
 
 
516 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  39.52 
 
 
537 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  40.54 
 
 
400 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  39.2 
 
 
514 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  39.76 
 
 
1562 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  37.72 
 
 
536 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  41.92 
 
 
746 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  31.39 
 
 
260 aa  105  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  57.58 
 
 
888 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  37.5 
 
 
522 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  40.24 
 
 
523 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  55.1 
 
 
735 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  38.92 
 
 
528 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  38.32 
 
 
892 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  37.72 
 
 
888 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  39.55 
 
 
432 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  37.28 
 
 
523 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  29.39 
 
 
273 aa  85.5  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  28.32 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  25.71 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  27.05 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  29.71 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  28.03 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  25.64 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  27.24 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  27.51 
 
 
275 aa  63.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  25.98 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  24.62 
 
 
279 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  24.23 
 
 
281 aa  60.1  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  25.48 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  27.62 
 
 
274 aa  59.7  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  24.74 
 
 
303 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  26.79 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  23.15 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  26.56 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  23.37 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  25.19 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  25.84 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  24.37 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1582  flagellin  25.81 
 
 
287 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000267264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1706  flagellin  25.81 
 
 
287 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0636682  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  23.71 
 
 
282 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  25.42 
 
 
328 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  23.57 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  25.27 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  24.71 
 
 
263 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  26.79 
 
 
281 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  26.79 
 
 
281 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  23.37 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  23.19 
 
 
266 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  27.31 
 
 
314 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  23.21 
 
 
302 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  23.84 
 
 
301 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  22.95 
 
 
320 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0992  flagellin domain protein  23.9 
 
 
285 aa  51.6  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  23.86 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  25.1 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  22.4 
 
 
320 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  22.4 
 
 
320 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  25.25 
 
 
320 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  22.08 
 
 
320 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0803  flagellin domain protein  28.52 
 
 
273 aa  50.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0196  flagellin domain-containing protein  27.82 
 
 
299 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  25.19 
 
 
275 aa  49.3  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  26.24 
 
 
283 aa  49.3  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  24.11 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>