More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0268 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  100 
 
 		 321 aa  644    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  63.12 
 
 		 320 aa  394  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  58.13 
 
 		 320 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  57.5 
 
 		 320 aa  362  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  57.19 
 
 		 320 aa  362  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  56.56 
 
 		 320 aa  349  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  55.66 
 
 		 303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  55.86 
 
 		 302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  55.11 
 
 		 302 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  54.94 
 
 		 303 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  56.27 
 
 		 302 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0331  flagellin domain protein  51.4 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0363  flagellin domain protein  51.09 
 
 		 320 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0920574  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  53.23 
 
 		 301 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  55.02 
 
 		 311 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  55.25 
 
 		 302 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  52.92 
 
 		 301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  48.86 
 
 		 395 aa  301  7.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  44.48 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  48.51 
 
 		 311 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2555  flagellin domain protein  45.59 
 
 		 332 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2814  flagellin domain protein  46.53 
 
 		 332 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  48.6 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  44.01 
 
 		 327 aa  218  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  60.73 
 
 		 395 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3219  flagella associated protein  40.8 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  60 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  40.81 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  42.68 
 
 		 289 aa  202  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  39.56 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  43.69 
 
 		 282 aa  189  8e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  33.7 
 
 		 364 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  46.33 
 
 		 461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  46.37 
 
 		 592 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  45.3 
 
 		 585 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  45.76 
 
 		 461 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  35.65 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  39.46 
 
 		 439 aa  159  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  44.13 
 
 		 590 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  45.56 
 
 		 494 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  35.08 
 
 		 281 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  34.44 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  32.92 
 
 		 282 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  44.71 
 
 		 269 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  32.3 
 
 		 277 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  31.27 
 
 		 273 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  31.89 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  31.41 
 
 		 273 aa  136  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  31.56 
 
 		 279 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  30.43 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  34.38 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  31.25 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  40.36 
 
 		 516 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  37.89 
 
 		 582 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  33.33 
 
 		 281 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 		 281 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  39.16 
 
 		 522 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  38.46 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  30.57 
 
 		 282 aa  114  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  52.83 
 
 		 389 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  29.18 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  40.29 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2876  flagellin-like  28.12 
 
 		 282 aa  99.4  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  29.01 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0108  flagellin domain-containing protein  29.49 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  27.61 
 
 		 289 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  35.77 
 
 		 274 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  31.95 
 
 		 274 aa  86.3  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  35.34 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  25.93 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  25.62 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  25.93 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1582  flagellin  24.61 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000267264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1706  flagellin  24.61 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0636682  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  24.07 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  23.99 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  23.77 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  23.77 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  26.58 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1635  flagellin B  34.51 
 
 		 519 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  24.09 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  23.05 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1636  flagellin B  34.51 
 
 		 518 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0196  flagellin domain-containing protein  26.67 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  24.92 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  36.36 
 
 		 630 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1726  flagellin  23.16 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000528146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  24.54 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  31.82 
 
 		 620 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  23.24 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  38.96 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  32.95 
 
 		 693 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  31.82 
 
 		 692 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  27.15 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001174  flagellin protein flaA  24.2 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  25.46 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  35.23 
 
 		 1562 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  25.08 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  36.36 
 
 		 399 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  37.14 
 
 		 432 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>