90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3880 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  100 
 
 		 1562 aa  2950    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  58.68 
 
 		 693 aa  505  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  57.74 
 
 		 692 aa  498  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  56.24 
 
 		 620 aa  432  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  60.69 
 
 		 630 aa  415  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  43.63 
 
 		 523 aa  231  6e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  47.4 
 
 		 762 aa  217  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  48.48 
 
 		 892 aa  216  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  48.38 
 
 		 514 aa  213  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  48.38 
 
 		 522 aa  210  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  48.88 
 
 		 523 aa  208  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  47.58 
 
 		 737 aa  206  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  46.34 
 
 		 888 aa  205  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  47.29 
 
 		 516 aa  205  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  47.04 
 
 		 888 aa  205  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  49.61 
 
 		 886 aa  204  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  48.67 
 
 		 746 aa  199  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  47.17 
 
 		 528 aa  197  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  47.06 
 
 		 753 aa  194  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  47.58 
 
 		 735 aa  193  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  43.88 
 
 		 886 aa  192  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  54.5 
 
 		 399 aa  191  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  56.5 
 
 		 399 aa  191  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  39.47 
 
 		 536 aa  189  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  39.43 
 
 		 537 aa  188  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  56.59 
 
 		 397 aa  183  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  55.5 
 
 		 399 aa  181  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  48.95 
 
 		 405 aa  173  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  41.81 
 
 		 572 aa  172  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  48.95 
 
 		 405 aa  171  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  48.95 
 
 		 405 aa  171  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  54 
 
 		 400 aa  169  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  53.71 
 
 		 420 aa  169  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  52.84 
 
 		 432 aa  169  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  52.13 
 
 		 405 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  51.6 
 
 		 405 aa  166  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  41.64 
 
 		 578 aa  166  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  39.57 
 
 		 393 aa  153  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  50.3 
 
 		 375 aa  153  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  39.9 
 
 		 300 aa  119  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  43.64 
 
 		 272 aa  115  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  43.64 
 
 		 272 aa  115  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  41.57 
 
 		 272 aa  110  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  41.92 
 
 		 275 aa  108  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  40.88 
 
 		 275 aa  107  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  39.76 
 
 		 272 aa  107  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  41.32 
 
 		 272 aa  105  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  39.39 
 
 		 272 aa  104  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  35.16 
 
 		 289 aa  96.3  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  45.26 
 
 		 547 aa  83.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  33.9 
 
 		 260 aa  83.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  34.94 
 
 		 273 aa  68.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  31.36 
 
 		 273 aa  63.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  32.69 
 
 		 273 aa  60.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  35.23 
 
 		 321 aa  59.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  36.9 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  34.78 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  32.53 
 
 		 272 aa  58.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  38.38 
 
 		 302 aa  57.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  33.7 
 
 		 395 aa  56.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  29.26 
 
 		 292 aa  56.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  32.97 
 
 		 320 aa  56.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  37.36 
 
 		 302 aa  55.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  30.77 
 
 		 585 aa  55.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  36.99 
 
 		 320 aa  55.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  40.28 
 
 		 311 aa  53.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  38.89 
 
 		 389 aa  54.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  35.16 
 
 		 301 aa  53.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  34.25 
 
 		 320 aa  53.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  34.07 
 
 		 302 aa  53.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  31.43 
 
 		 439 aa  52.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  38.1 
 
 		 289 aa  52.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  30.77 
 
 		 320 aa  52.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  28.19 
 
 		 301 aa  51.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  26.47 
 
 		 282 aa  50.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  32.97 
 
 		 302 aa  50.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  38.57 
 
 		 380 aa  49.7  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  27.78 
 
 		 277 aa  49.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0444  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  45.1 
 
 		 587 aa  48.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0985336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  36.99 
 
 		 303 aa  48.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  33.68 
 
 		 327 aa  48.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  35.06 
 
 		 320 aa  48.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  28.74 
 
 		 279 aa  48.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  33.33 
 
 		 303 aa  48.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  32.88 
 
 		 282 aa  47.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  26.22 
 
 		 281 aa  46.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  33.04 
 
 		 592 aa  46.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  27.44 
 
 		 275 aa  45.4  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  29.05 
 
 		 687 aa  45.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  29.76 
 
 		 277 aa  45.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>