More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0196 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0196  flagellin domain-containing protein  100 
 
 		 299 aa  591  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001174  flagellin protein flaA  52.84 
 
 		 281 aa  291  9e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  53.49 
 
 		 289 aa  285  7e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0151  flagellin D  52.67 
 
 		 296 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979093  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0199  flagellin  52 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161048  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4651  flagellin domain-containing protein  49.35 
 
 		 303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708723  normal  0.498998 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3589  flagellin domain-containing protein  44.96 
 
 		 341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3455  flagellin domain-containing protein  50.34 
 
 		 270 aa  249  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3587  flagellin domain-containing protein  43.59 
 
 		 345 aa  249  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3358  flagellin domain-containing protein  48.28 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0276  lateral flagellar flagellin LafA  48.28 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0420312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3456  flagellin domain-containing protein  47.64 
 
 		 267 aa  243  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0057  flagellin domain-containing protein  47.47 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3956  flagellin domain-containing protein  47.64 
 
 		 272 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3959  flagellin domain-containing protein  48.31 
 
 		 270 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3957  flagellin domain-containing protein  46.28 
 
 		 267 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3958  flagellin domain-containing protein  46.62 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3639  flagellin-like protein  45.64 
 
 		 266 aa  228  6e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0063  flagellin domain-containing protein  45.12 
 
 		 272 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  44.85 
 
 		 276 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  43.29 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  43.29 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  43.81 
 
 		 272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  43.81 
 
 		 272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  44.33 
 
 		 283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  43.29 
 
 		 279 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  43.29 
 
 		 271 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  43.29 
 
 		 271 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  42.47 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  42.47 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  44.55 
 
 		 280 aa  205  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  42.33 
 
 		 279 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  42.62 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  41.04 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  42.11 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  41.37 
 
 		 294 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  41.55 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  40.53 
 
 		 287 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  41.47 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  41.14 
 
 		 273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  40 
 
 		 273 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  40.72 
 
 		 294 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  41.14 
 
 		 273 aa  195  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  42.47 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  43 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  41.45 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  39.8 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  38.8 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  38.13 
 
 		 275 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  41.28 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  40.47 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  41.28 
 
 		 272 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  42.47 
 
 		 273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  40.67 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  42.62 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  40.47 
 
 		 271 aa  188  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  40.27 
 
 		 271 aa  188  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  39.93 
 
 		 270 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  41.47 
 
 		 272 aa  188  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  39.46 
 
 		 273 aa  188  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  38.26 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  40.13 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  42.28 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  38.69 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  40.48 
 
 		 281 aa  186  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  37.58 
 
 		 274 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  40.13 
 
 		 273 aa  185  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  40.47 
 
 		 272 aa  185  8e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  39.8 
 
 		 271 aa  185  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  40.83 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  0.00000486769 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  42.62 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  42.62 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  40.53 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  35.19 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  41.81 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  40.27 
 
 		 271 aa  182  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  39.87 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3588  flagellin domain-containing protein  52.49 
 
 		 392 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  39.87 
 
 		 282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  38.8 
 
 		 276 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  35.36 
 
 		 379 aa  179  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  38.46 
 
 		 278 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  40.6 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  40.6 
 
 		 263 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  38.46 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  41.12 
 
 		 283 aa  175  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  39.6 
 
 		 314 aa  175  9e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  37.79 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  37.54 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  40.96 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  34.57 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  38.26 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  38.89 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  41.75 
 
 		 288 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  36.63 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  38.28 
 
 		 295 aa  172  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  37.25 
 
 		 272 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  41.67 
 
 		 272 aa  171  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  38.31 
 
 		 282 aa  172  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  38.49 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.414815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>