283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2974 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  100 
 
 		 282 aa  545  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  85.11 
 
 		 282 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  83.33 
 
 		 281 aa  439  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  75.53 
 
 		 292 aa  421  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  80.07 
 
 		 281 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  51.06 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  51.06 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2876  flagellin-like  49.65 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  54.96 
 
 		 284 aa  242  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  58.33 
 
 		 522 aa  179  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  41.04 
 
 		 302 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  55.11 
 
 		 516 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  38.56 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  38.56 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  36.91 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  38.56 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  37.91 
 
 		 301 aa  168  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  38.56 
 
 		 302 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  37.62 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  34.84 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  35.79 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  32.63 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  36.17 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  32.3 
 
 		 320 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  32.3 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  32.92 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  31.99 
 
 		 320 aa  145  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  34.74 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  35.03 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  31.99 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  36.49 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  40.48 
 
 		 282 aa  141  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  34.69 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  34.58 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  37.27 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  36.49 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  34.72 
 
 		 272 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  32.29 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  33.97 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  32.29 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  35.91 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  31.63 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  29.08 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  41.01 
 
 		 395 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  39.34 
 
 		 395 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  43.48 
 
 		 395 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  38.15 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3219  flagella associated protein  28.08 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  37.02 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2555  flagellin domain protein  29.06 
 
 		 332 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  28.04 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2814  flagellin domain protein  29.47 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0363  flagellin domain protein  25.74 
 
 		 320 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0920574  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0331  flagellin domain protein  26.69 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  31.51 
 
 		 592 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  35.77 
 
 		 494 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  35.04 
 
 		 439 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  35.04 
 
 		 461 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  31.72 
 
 		 461 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 		 585 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  50.56 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  32.12 
 
 		 590 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  26.79 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  34.31 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  32.59 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  34.93 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  28.42 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0108  flagellin domain-containing protein  27.95 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  29.2 
 
 		 582 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  24.24 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  24.91 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  26.04 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  26.04 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  25.52 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  24.4 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2561  flagellin domain protein  28.03 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  24.11 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  24.56 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  23.57 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  24.56 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0623  flagellin domain protein  26.28 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  26.55 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  23.71 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  23.65 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0866  flagellin-like  28.18 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  24.83 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  23.88 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  24.3 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27700  Flagellin  32.41 
 
 		 567 aa  59.3  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  29.84 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  26.21 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  24.65 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  24.59 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  25.17 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  25 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  24.13 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0707  flagellin domain protein  25.77 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.478306  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  24.65 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2158  flagellin  33.08 
 
 		 579 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  30.06 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>