284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3878 on replicon NC_009007
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009007  RSP_3878  flagellin  100 
 
 		 281 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  100 
 
 		 281 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  59.43 
 
 		 284 aa  290  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  54.8 
 
 		 281 aa  286  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  53.19 
 
 		 282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  49.65 
 
 		 292 aa  265  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  51.06 
 
 		 282 aa  265  8e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  51.06 
 
 		 281 aa  229  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2876  flagellin-like  43.26 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  39.44 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  38.38 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  36.22 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  38.03 
 
 		 274 aa  159  7e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  36.25 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  35.69 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  36.72 
 
 		 302 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  36.27 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  35.69 
 
 		 303 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  39.39 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  46.8 
 
 		 516 aa  151  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  47 
 
 		 522 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  36.16 
 
 		 302 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  38.03 
 
 		 273 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  35.83 
 
 		 301 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  33.64 
 
 		 320 aa  148  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  38.43 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  35.83 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  39.46 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 		 321 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  36.51 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  35.54 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  31.27 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  36.33 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  30.65 
 
 		 320 aa  136  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  32.4 
 
 		 320 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  34.74 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  34.15 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  34.15 
 
 		 277 aa  132  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  36.47 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  32.7 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  31.15 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  34.03 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  37.11 
 
 		 282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  37.11 
 
 		 395 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  31.52 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  36.79 
 
 		 395 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2814  flagellin domain protein  31.31 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  39.13 
 
 		 395 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2555  flagellin domain protein  28.88 
 
 		 332 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  28.35 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0331  flagellin domain protein  26.14 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  53.26 
 
 		 389 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  51.19 
 
 		 380 aa  88.6  9e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  28.66 
 
 		 321 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0108  flagellin domain-containing protein  30.57 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  35.84 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  36.42 
 
 		 592 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  33.68 
 
 		 494 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  38.51 
 
 		 585 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  35.23 
 
 		 590 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3219  flagella associated protein  30.95 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  40.48 
 
 		 461 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  40.48 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  29.2 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  48.81 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  32.07 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  44.83 
 
 		 582 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  27.92 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  28.57 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  29.79 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  28.57 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  28.3 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  27.7 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  28.47 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  28.47 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  29.59 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  26.79 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  26.6 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  40.54 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  29.73 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3618  flagellin  26.64 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000440531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  30.33 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  27.17 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  27.78 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  28.37 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  31.65 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1581  flagellin domain-containing protein  27.53 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014777  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0760  flagellin-like  28.87 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  23.94 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0363  flagellin domain protein  30.08 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0920574  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  26.6 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  27.37 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  26.91 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  27.56 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  27.95 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0063  flagellin domain-containing protein  26.35 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  26.6 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  27.56 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  26.5 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  27.37 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>