More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1138 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1138  flagellin  100 
 
 		 321 aa  642    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  44.48 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  45.09 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  44.55 
 
 		 320 aa  252  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  44.24 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  43.94 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  44.24 
 
 		 320 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  43.3 
 
 		 303 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  37.31 
 
 		 395 aa  225  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2555  flagellin domain protein  39.31 
 
 		 332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2814  flagellin domain protein  39.62 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  41.74 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  41.3 
 
 		 303 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0331  flagellin domain protein  38 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  43.69 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  41.8 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  40.56 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  39.13 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  40.5 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  41.12 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0363  flagellin domain protein  36.5 
 
 		 320 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0920574  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  40.48 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3219  flagella associated protein  35.45 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  46.6 
 
 		 395 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  47.12 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  35.69 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  35.78 
 
 		 327 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  36.84 
 
 		 289 aa  152  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  33.23 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  32.92 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  35.09 
 
 		 282 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  40.32 
 
 		 585 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  41.86 
 
 		 439 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  42.44 
 
 		 494 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  41.28 
 
 		 592 aa  122  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  41.52 
 
 		 461 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  40.94 
 
 		 461 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  40.46 
 
 		 590 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  27.67 
 
 		 364 aa  116  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  29.63 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  36.27 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  28.62 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  26.73 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  27.64 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  29.46 
 
 		 282 aa  99.4  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  28.66 
 
 		 281 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  28.09 
 
 		 282 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  28.09 
 
 		 273 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  28.34 
 
 		 282 aa  95.5  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  31.71 
 
 		 522 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  31.33 
 
 		 516 aa  94  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  27.78 
 
 		 273 aa  93.2  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  28.03 
 
 		 273 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  31.2 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  26.96 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  34.12 
 
 		 582 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  29.75 
 
 		 277 aa  90.1  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  35.82 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2876  flagellin-like  27.98 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  26.23 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  30.26 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  30.64 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  36.96 
 
 		 389 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  31.11 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  28.66 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  28.66 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  44.93 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  24.74 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  25.46 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  22.77 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  26.32 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004160  flagellin protein flaE  29.2 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000739786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  31.25 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  26.69 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01302  flagellin  29.2 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  24.68 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0276  lateral flagellar flagellin LafA  25.96 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0420312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  23.53 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3358  flagellin domain-containing protein  25.96 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  24.85 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  24.39 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  24.77 
 
 		 377 aa  57  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  31.82 
 
 		 402 aa  57  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  32.26 
 
 		 405 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  24.77 
 
 		 377 aa  57  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0707  flagellin domain protein  30.66 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.478306  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  25.25 
 
 		 376 aa  57  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  24.85 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  33.33 
 
 		 693 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  30.94 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  24.25 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  31.18 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  23.92 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4651  flagellin domain-containing protein  23.33 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708723  normal  0.498998 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  28.47 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  29.92 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  30.94 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  0.00000486769 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3618  flagellin  23.12 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000440531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1339  flagellin  29.32 
 
 		 576 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  32.26 
 
 		 692 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>