34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0654 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0691  protein of unknown function DUF1217  88.73 
 
 		 417 aa  704    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0654  protein of unknown function DUF1217  100 
 
 		 417 aa  813    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0680  hypothetical protein  87.77 
 
 		 417 aa  696    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6503  hypothetical protein  61.69 
 
 		 414 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6502  hypothetical protein  54.46 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315608 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4216  hypothetical protein  56.56 
 
 		 264 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.338964  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0118  hypothetical protein  55.74 
 
 		 262 aa  139  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0969  hypothetical protein  28.95 
 
 		 727 aa  137  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.685924  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2474  hypothetical protein  59.82 
 
 		 801 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.958646 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0127  hypothetical protein  55.08 
 
 		 258 aa  133  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0251  hypothetical protein  54.1 
 
 		 259 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00748902  normal  0.467575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1710  hypothetical protein  50 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214563  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0545  protein of unknown function DUF1217  54 
 
 		 1111 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000988824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0592  protein of unknown function DUF1217  50 
 
 		 1111 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.535986 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5534  protein of unknown function DUF1217  47.92 
 
 		 738 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0302  hypothetical protein  46.34 
 
 		 258 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202407  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0479  hypothetical protein  50.43 
 
 		 822 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1655  protein of unknown function DUF1217  49.57 
 
 		 259 aa  110  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.939234 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5254  protein of unknown function DUF1217  42.75 
 
 		 727 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2809  hypothetical protein  41.96 
 
 		 259 aa  101  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.311131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1147  hypothetical protein  44.17 
 
 		 264 aa  97.8  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3881  flagellar basal-body rod protein FLGF  42.42 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0287836  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4159  hypothetical protein  42.42 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0365541  normal  0.446399 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4200  flagellar protein, putative  35.48 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.628591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2971  hypothetical protein  37.78 
 
 		 650 aa  75.5  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.123475 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3358  protein of unknown function DUF1217  40 
 
 		 263 aa  72.8  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1618  flagellar protein, putative  28 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  45.1 
 
 		 582 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  33.12 
 
 		 590 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3449  hypothetical protein  26.67 
 
 		 281 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.419129 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  35.14 
 
 		 439 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0105  hypothetical protein  28.57 
 
 		 290 aa  47  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  41.33 
 
 		 592 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.17 
 
 		 6889 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>