29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4216 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4216  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  539  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.338964  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0118  hypothetical protein  87.4 
 
 
262 aa  491  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0127  hypothetical protein  86.43 
 
 
258 aa  476  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0302  hypothetical protein  52.76 
 
 
258 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202407  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0251  hypothetical protein  51.91 
 
 
259 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00748902  normal  0.467575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2809  hypothetical protein  46.74 
 
 
259 aa  242  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.311131  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1655  protein of unknown function DUF1217  42.53 
 
 
259 aa  221  7e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.939234 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1147  hypothetical protein  38.15 
 
 
264 aa  202  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5254  protein of unknown function DUF1217  40.25 
 
 
727 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5534  protein of unknown function DUF1217  39.08 
 
 
738 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0545  protein of unknown function DUF1217  39.3 
 
 
1111 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000988824  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0592  protein of unknown function DUF1217  39.81 
 
 
1111 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.535986 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0969  hypothetical protein  37.21 
 
 
727 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.685924  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2474  hypothetical protein  33.72 
 
 
801 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.958646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0680  hypothetical protein  57.38 
 
 
417 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0691  protein of unknown function DUF1217  57.38 
 
 
417 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0654  protein of unknown function DUF1217  56.56 
 
 
417 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0479  hypothetical protein  36.96 
 
 
822 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4200  flagellar protein, putative  31.98 
 
 
265 aa  135  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.628591  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6502  hypothetical protein  55.14 
 
 
429 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6503  hypothetical protein  57.73 
 
 
414 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1710  hypothetical protein  32.92 
 
 
472 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214563  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3358  protein of unknown function DUF1217  30.67 
 
 
263 aa  125  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4159  hypothetical protein  28.51 
 
 
262 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0365541  normal  0.446399 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3881  flagellar basal-body rod protein FLGF  28.11 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0287836  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2971  hypothetical protein  38.1 
 
 
650 aa  93.2  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.123475 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3449  hypothetical protein  26.18 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.419129 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0105  hypothetical protein  24.12 
 
 
290 aa  87  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1618  flagellar protein, putative  21.77 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>